More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3098 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  100 
 
 		 451 aa  932    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  66.59 
 
 		 453 aa  639    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  46.54 
 
 		 420 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  44.52 
 
 		 461 aa  348  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  44.06 
 
 		 461 aa  346  4e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2874  twin-arginine translocation pathway signal  43.53 
 
 		 457 aa  346  6e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6939  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.13 
 
 		 417 aa  340  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3624  oxidoreductase molybdopterin binding protein  41.45 
 
 		 411 aa  322  7e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  42.59 
 
 		 410 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0005  molybdopterin oxidoreductase family protein  39.95 
 
 		 412 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0031  molybdopterin oxidoreductase family protein  39.95 
 
 		 412 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.589272  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0007  molybdopterin oxidoreductase family protein  41.2 
 
 		 416 aa  312  6.999999999999999e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  42.6 
 
 		 408 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  45.04 
 
 		 408 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.19 
 
 		 408 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  43.82 
 
 		 408 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.19 
 
 		 408 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  44.19 
 
 		 408 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  33.81 
 
 		 401 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  34.56 
 
 		 401 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  33.84 
 
 		 403 aa  204  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  33.41 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  36.16 
 
 		 417 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  32.32 
 
 		 414 aa  199  9e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  32.33 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 412 aa  196  6e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  33.02 
 
 		 405 aa  196  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  33.02 
 
 		 405 aa  196  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  33.61 
 
 		 412 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.32 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  33.42 
 
 		 402 aa  193  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  33.89 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  33.89 
 
 		 403 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  32.68 
 
 		 414 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  34.38 
 
 		 369 aa  189  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  30.36 
 
 		 369 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  32.81 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  33.33 
 
 		 409 aa  186  8e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  30.62 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.01 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.4 
 
 		 416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  30.14 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  33.68 
 
 		 414 aa  183  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.64 
 
 		 400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  32.4 
 
 		 407 aa  180  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  32.3 
 
 		 370 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  33.15 
 
 		 426 aa  173  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.88 
 
 		 415 aa  172  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  31.18 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  32.69 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  34.82 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  32.47 
 
 		 372 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  34.06 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  34.06 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  31.54 
 
 		 407 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  34.08 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  31.3 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  32.85 
 
 		 431 aa  152  8.999999999999999e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  28.37 
 
 		 363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.68 
 
 		 415 aa  147  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.82 
 
 		 400 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.62 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  32.92 
 
 		 440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  31.76 
 
 		 431 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  29.41 
 
 		 367 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  31.19 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44482  predicted protein  31.23 
 
 		 600 aa  139  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00564143  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  30.41 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  31.64 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  31.45 
 
 		 425 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  31.56 
 
 		 430 aa  137  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  31.45 
 
 		 425 aa  136  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  29.88 
 
 		 445 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.46 
 
 		 430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.52 
 
 		 406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  32.08 
 
 		 420 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  31.21 
 
 		 405 aa  132  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  30.09 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.34 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  31.52 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.77 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  30.3 
 
 		 414 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.26 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  29.91 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  29.79 
 
 		 407 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3676  sulfur dehydrogenase subunit SoxC  30.72 
 
 		 427 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  29.5 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  28.97 
 
 		 437 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  29.22 
 
 		 409 aa  126  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  30.88 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  29.1 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  30.79 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3018  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.49 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  26.21 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.52 
 
 		 414 aa  124  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  29.28 
 
 		 349 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.58 
 
 		 501 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  29.19 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.35 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.35 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0853456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>