102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3041 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 405 aa  830    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 402 aa  290  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0062  response regulator receiver domain-containing protein  25.72 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000342742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  27 
 
 		 369 aa  99.8  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 368 aa  94.4  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  26.63 
 
 		 373 aa  94  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 405 aa  89.7  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  25.71 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 362 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  22.89 
 
 		 367 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 385 aa  86.3  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  26.34 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0514  regulatory protein, LuxR  25.07 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  25.5 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  23.72 
 
 		 374 aa  82.8  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  27.88 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  26.19 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  25.56 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  24.12 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  27.08 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  25.82 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  27.08 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  26.22 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  27.38 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  26.49 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  28.08 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  23.54 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  25.27 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  25.41 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  27.47 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  27.47 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  23.8 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  19.89 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  27.08 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 377 aa  69.7  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  24.74 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  22.22 
 
 		 378 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0039  LuxR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 369 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1538  LuxR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  23.08 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  22.54 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  22.37 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0744  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 367 aa  57  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  28.49 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  39.53 
 
 		 187 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1320  transcriptional regulator  25 
 
 		 365 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2036  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 588 aa  53.9  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.743168  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 191 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  38.57 
 
 		 321 aa  53.9  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3316  LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 207 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.764523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2538  transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 188 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 394 aa  53.5  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  26.56 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 229 aa  52.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6522  transcriptional regulator, LuxR family  27.03 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2058  regulatory protein, LuxR  25.91 
 
 		 370 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  26.01 
 
 		 325 aa  50.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2021  hypothetical protein  25.23 
 
 		 280 aa  50.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1367  regulatory protein, LuxR  27.43 
 
 		 275 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210507 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3602  hypothetical protein  30.95 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  44.93 
 
 		 586 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1423  LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 227 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000143739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2318  LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 151 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  45.31 
 
 		 568 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1879  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  30.69 
 
 		 839 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3804  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.73714  normal  0.702757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2665  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1356  regulatory protein, LuxR  35.37 
 
 		 217 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6247  transcriptional regulator, LuxR family  33.91 
 
 		 352 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.670073 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.29 
 
 		 536 aa  44.3  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4005  transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 213 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.469867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>