84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2783 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  100 
 
 
94 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  59.14 
 
 
94 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  58.06 
 
 
94 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  58.06 
 
 
94 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  58.06 
 
 
94 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  58.06 
 
 
94 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  55.32 
 
 
94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  52.75 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  60 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  52.22 
 
 
93 aa  103  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  50 
 
 
94 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  45.65 
 
 
93 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  45.74 
 
 
93 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  46.74 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  38.89 
 
 
90 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.93 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.46 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.66 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  42.22 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  38.2 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  37.36 
 
 
96 aa  67  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  37.78 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  39.47 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  33.33 
 
 
100 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  37.08 
 
 
95 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  37.5 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  36.05 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  37.36 
 
 
94 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  36.26 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  39.47 
 
 
79 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.11 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.3 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  31.82 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  39.08 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.08 
 
 
95 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  37.21 
 
 
91 aa  57.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  35.48 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  42.05 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  42.05 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  35.16 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  32.97 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  37.93 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  33.72 
 
 
94 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.56 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  34.44 
 
 
96 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  34.48 
 
 
101 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  32.56 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  38.04 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  38.04 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  33.72 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  40.21 
 
 
103 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3172  plasmid stabilization system  39.77 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_53  putative plasmid stabilization system protein  32.18 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000087371  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  38.64 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3526  addiction module antitoxin  30 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0820981  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2625  plasmid stabilization system  33.71 
 
 
96 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.111441  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3491  plasmid stabilization system  33.71 
 
 
96 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  31.82 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  34.78 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.18 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6361  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.58 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  30.53 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  34.44 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0575  hypothetical protein  30.43 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.287288  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0836  plasmid stabilization system  30 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0264  plasmid stabilization system  30.77 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2119  plasmid stabilization system protein  28.26 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000247213  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  30.65 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1695  plasmid stabilization system  32.58 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1265  plasmid stabilization system  29.21 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526414  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0834  hypothetical protein  54.55 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  29.41 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1180  plasmid stabilization system  28.89 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0699  plasmid stabilization system protein  34.83 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00627414  normal  0.782254 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2623  plasmid stabilization system protein  31.52 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1748  plasmid stabilization system protein  32.58 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  31.91 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.82 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4341  plasmid stabilization system protein  29.67 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.586158  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0093  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  25.29 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00661999  normal 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0021  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  26.44 
 
 
91 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.941725  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  32.14 
 
 
95 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4341  plasmid stabilization system protein  28.09 
 
 
97 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0257549  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>