18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2781 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2781  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  720    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000711113  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1814  Outer membrane protein (porin)-like protein  37.74 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000274803  hitchhiker  0.000000000255936 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1947  hypothetical protein  24.66 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309501  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0230  putative outer membrane protein  26.27 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  36 
 
 		 372 aa  54.3  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  28.73 
 
 		 338 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2561  porin  37.57 
 
 		 427 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000690644  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3752  porin  29.58 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0613  porin  29.58 
 
 		 355 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0640  porin  29.58 
 
 		 355 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0635  outer membrane insertion C-terminal signal  29.58 
 
 		 355 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  29.52 
 
 		 353 aa  46.6  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  31.54 
 
 		 387 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  35.57 
 
 		 345 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  25 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  29.69 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  26.38 
 
 		 385 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  22.53 
 
 		 342 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>