More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2778 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  38.27 
 
 		 1218 aa  793    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.19 
 
 		 1304 aa  1509    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  60.7 
 
 		 1308 aa  1542    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  59.16 
 
 		 1345 aa  1555    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.73 
 
 		 1292 aa  1430    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.55 
 
 		 1340 aa  1524    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.85 
 
 		 1286 aa  1807    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  58.93 
 
 		 1342 aa  1538    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  58.7 
 
 		 1292 aa  1513    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  58.93 
 
 		 1342 aa  1539    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  60.37 
 
 		 1291 aa  1557    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  59.1 
 
 		 1324 aa  1553    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  58.78 
 
 		 1342 aa  1536    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  64.61 
 
 		 1259 aa  1681    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  75.55 
 
 		 1280 aa  2031    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.56 
 
 		 1218 aa  791    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  61.38 
 
 		 1292 aa  1567    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  58.93 
 
 		 1342 aa  1539    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  59.15 
 
 		 1345 aa  1548    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  58.93 
 
 		 1342 aa  1538    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  38.36 
 
 		 1221 aa  818    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  38.7 
 
 		 1212 aa  789    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  58.93 
 
 		 1342 aa  1538    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  58.31 
 
 		 1341 aa  1527    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  38.02 
 
 		 1217 aa  792    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  38.43 
 
 		 1210 aa  788    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  37.68 
 
 		 1214 aa  785    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  58.98 
 
 		 1279 aa  1516    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  64.43 
 
 		 1277 aa  1655    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  38.17 
 
 		 1202 aa  806    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  58.93 
 
 		 1342 aa  1538    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  59.2 
 
 		 1359 aa  1532    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.8 
 
 		 1279 aa  1526    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  38.55 
 
 		 1213 aa  792    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 1289 aa  2653    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  58.34 
 
 		 1307 aa  1511    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  65.23 
 
 		 1271 aa  1708    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  59.2 
 
 		 1300 aa  1518    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.9 
 
 		 1309 aa  1499    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  56.65 
 
 		 1307 aa  1466    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  57.43 
 
 		 1349 aa  1538    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.01 
 
 		 1304 aa  1499    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.9 
 
 		 1344 aa  1538    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  59.38 
 
 		 1308 aa  1494    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  58.74 
 
 		 1324 aa  1550    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  64.43 
 
 		 1277 aa  1655    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  58.73 
 
 		 1341 aa  1531    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  59.22 
 
 		 1345 aa  1549    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  57.43 
 
 		 1364 aa  1543    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  72.35 
 
 		 1288 aa  1911    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.71 
 
 		 1265 aa  1474    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.32 
 
 		 1340 aa  1523    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.73 
 
 		 1341 aa  1531    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  58.73 
 
 		 1341 aa  1531    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  38.39 
 
 		 1212 aa  790    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.96 
 
 		 1307 aa  1470    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  57.07 
 
 		 1282 aa  1481    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.89 
 
 		 1371 aa  1507    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.29 
 
 		 1187 aa  534  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  32.94 
 
 		 1197 aa  534  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  33.3 
 
 		 1188 aa  533  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  30.14 
 
 		 1183 aa  524  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  31.81 
 
 		 1183 aa  509  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.47 
 
 		 1227 aa  416  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  32.74 
 
 		 1204 aa  285  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.34 
 
 		 434 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  24.69 
 
 		 456 aa  109  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4582  FAD linked oxidase domain protein  37.97 
 
 		 477 aa  107  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000242662  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1012  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  23.73 
 
 		 430 aa  106  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.39 
 
 		 411 aa  106  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0394  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.34 
 
 		 479 aa  106  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.413776 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.16 
 
 		 469 aa  104  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0843  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  22.2 
 
 		 418 aa  103  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000303103  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0494  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.97 
 
 		 479 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.159289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0450  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.02 
 
 		 479 aa  102  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.72 
 
 		 460 aa  102  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.72 
 
 		 460 aa  102  6e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.72 
 
 		 460 aa  102  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0859  FAD linked oxidase domain protein  37.97 
 
 		 477 aa  102  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.70916 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.58 
 
 		 460 aa  101  7e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0923  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.97 
 
 		 477 aa  100  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0282812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0884  FAD linked oxidase domain protein  37.97 
 
 		 477 aa  100  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.931044 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1372  hypothetical protein  22.43 
 
 		 423 aa  101  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000298572  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 987 aa  100  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0959  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  26.56 
 
 		 501 aa  100  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.967814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5786  glycolate oxidase subunit GlcD  34.41 
 
 		 477 aa  99.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  23.93 
 
 		 952 aa  98.6  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  26.02 
 
 		 485 aa  97.8  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.27 
 
 		 459 aa  97.4  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  25.65 
 
 		 459 aa  97.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  23.43 
 
 		 1013 aa  97.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.57 
 
 		 459 aa  98.2  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4325  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.32 
 
 		 477 aa  97.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73889  normal  0.0799258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  24.35 
 
 		 461 aa  96.3  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  23.93 
 
 		 461 aa  96.3  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.84 
 
 		 423 aa  96.3  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.71 
 
 		 494 aa  96.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  25.41 
 
 		 459 aa  96.3  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.04 
 
 		 493 aa  96.3  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3033  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.44 
 
 		 477 aa  96.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491318  normal  0.0473445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>