98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2729 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  750    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  68.21 
 
 
368 aa  497  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  57.61 
 
 
377 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  55.71 
 
 
377 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  51.76 
 
 
359 aa  302  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  47.28 
 
 
359 aa  299  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  42.54 
 
 
318 aa  264  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  35.99 
 
 
330 aa  211  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  34.81 
 
 
344 aa  192  8e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  31.87 
 
 
361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  31.65 
 
 
339 aa  147  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  33.96 
 
 
343 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  33.33 
 
 
335 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  33.33 
 
 
343 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  33.33 
 
 
343 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  32.1 
 
 
335 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  34.91 
 
 
343 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  33.02 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  33.02 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  32.71 
 
 
343 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  32.71 
 
 
343 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  32.71 
 
 
343 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  30.82 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  30.19 
 
 
343 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  34.48 
 
 
375 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  27.24 
 
 
392 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  28.75 
 
 
332 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  34.26 
 
 
377 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  34.26 
 
 
376 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  30.12 
 
 
380 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  28.4 
 
 
390 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  26.84 
 
 
375 aa  97.4  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  26.27 
 
 
330 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  29.34 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  28.53 
 
 
329 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  27.86 
 
 
342 aa  90.9  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  29.41 
 
 
402 aa  90.5  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  28.81 
 
 
320 aa  89.7  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  28.71 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  26.01 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  29.53 
 
 
325 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  26.01 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  26.01 
 
 
330 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  28.4 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  30.48 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  29.69 
 
 
318 aa  86.3  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  26.3 
 
 
330 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  26.3 
 
 
330 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  26.3 
 
 
330 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  22.25 
 
 
372 aa  84  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  27.38 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  28.1 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  26.23 
 
 
343 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  25.21 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  30.77 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  27.85 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  27.85 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  27.85 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  24.01 
 
 
384 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  28.38 
 
 
332 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  29.88 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  29.79 
 
 
364 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  26.49 
 
 
380 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2155  twin-arginine translocation pathway signal  25.31 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301738  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  24.76 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  30.49 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  27.65 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  23.82 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  26.22 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  26.62 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  26.94 
 
 
1006 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  22.98 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  22.98 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  22.98 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  25.96 
 
 
349 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  26.47 
 
 
351 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  25.39 
 
 
273 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  23.34 
 
 
771 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1994  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  30.66 
 
 
672 aa  54.3  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  24.3 
 
 
326 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  28.73 
 
 
817 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1381  putative nitroreductase  24.39 
 
 
355 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.940442  normal  0.168367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0204  hypothetical protein  26 
 
 
711 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1968  hypothetical protein  30.11 
 
 
726 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  24.06 
 
 
679 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  22.45 
 
 
332 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  21.79 
 
 
770 aa  49.7  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39940  hypothetical protein  26.86 
 
 
382 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.111954  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  23.3 
 
 
331 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  25.07 
 
 
344 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  23.87 
 
 
730 aa  46.2  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02470  hypothetical protein  31.18 
 
 
325 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  24.29 
 
 
684 aa  44.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3521  hypothetical protein  26.99 
 
 
353 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
336 aa  44.3  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12361  hypothetical protein  26.88 
 
 
372 aa  43.1  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  24.2 
 
 
331 aa  42.7  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4376  hypothetical protein  22.91 
 
 
710 aa  42.7  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209188  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>