More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2699 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  100 
 
 
231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1721  Methyltransferase type 12  55.8 
 
 
226 aa  261  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000160081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  50.23 
 
 
222 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  50.23 
 
 
226 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  50.93 
 
 
223 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1254  methyltransferase type 12  54.17 
 
 
226 aa  217  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.452774  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  50.23 
 
 
222 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54050  hypothetical protein  49.3 
 
 
221 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2488  methyltransferase type 11  50.7 
 
 
223 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  47.95 
 
 
237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  25.11 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  25.81 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  27.84 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 
337 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  27.84 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  28.75 
 
 
269 aa  65.1  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  30.29 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  26.55 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  21.26 
 
 
243 aa  63.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  31.46 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  41.35 
 
 
266 aa  62.4  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.5 
 
 
247 aa  62  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  28.8 
 
 
270 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  28.8 
 
 
270 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  28.8 
 
 
270 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  26.23 
 
 
226 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  33.53 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1872  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.34 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466783  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  31.95 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  26.23 
 
 
226 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1803  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.34 
 
 
248 aa  60.5  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0795517  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  29.48 
 
 
262 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.78 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.47 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
246 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.18 
 
 
243 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.89 
 
 
236 aa  59.3  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.33 
 
 
238 aa  59.3  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  26.67 
 
 
258 aa  58.9  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  23.32 
 
 
247 aa  59.3  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
252 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  29.48 
 
 
283 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  26.88 
 
 
236 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  29.14 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  30.34 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  25.59 
 
 
280 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
260 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  29.14 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  41.9 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.24 
 
 
234 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  29.14 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  29.48 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  29.14 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  29.48 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.27 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  32.38 
 
 
296 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2506  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.36 
 
 
248 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117869  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1033  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.85 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00915374  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0369  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.38 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  40.38 
 
 
259 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  26.63 
 
 
236 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  35.8 
 
 
251 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.31 
 
 
254 aa  56.2  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  33.64 
 
 
253 aa  56.2  0.0000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  30 
 
 
258 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  26.34 
 
 
236 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  26.34 
 
 
236 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  37.74 
 
 
249 aa  55.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  25.14 
 
 
226 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.13 
 
 
238 aa  55.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  36.29 
 
 
219 aa  55.5  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.38 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12360  methyltransferase family protein  39.39 
 
 
203 aa  55.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661079  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.45 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  32.77 
 
 
255 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.45 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  29.33 
 
 
262 aa  55.1  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
439 aa  55.1  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
238 aa  55.1  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  29.7 
 
 
280 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  26.09 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.29 
 
 
230 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  27.41 
 
 
208 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.38 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.77 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  30 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.38 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  35.17 
 
 
291 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1999  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
444 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>