More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2640 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  100 
 
 
150 aa  306  5e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0018  UspA domain protein  57.59 
 
 
162 aa  168  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0155  hypothetical protein  34.31 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  37.59 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.88 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  36 
 
 
304 aa  72  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  33.09 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.14 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  34.67 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  50 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  31.97 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  30.71 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  28.37 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  32.21 
 
 
152 aa  67  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  29.41 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  34.48 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  35.53 
 
 
314 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  31.91 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  34.51 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  34.51 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  34.51 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  34.01 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  32.14 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  30.87 
 
 
295 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  31.69 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  32.68 
 
 
307 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  34.9 
 
 
208 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  35.71 
 
 
290 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  28.95 
 
 
155 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  35.62 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0340  UspA domain protein  46.27 
 
 
160 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  29.41 
 
 
175 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  31.43 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  35.92 
 
 
159 aa  61.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  31.58 
 
 
173 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  32.21 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  28.87 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  32.86 
 
 
149 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  29.45 
 
 
154 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  32.64 
 
 
298 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  43.33 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  47.27 
 
 
120 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.48 
 
 
170 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  29.68 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.94 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.03 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.37 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.48 
 
 
170 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  42.86 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 
297 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  30.99 
 
 
142 aa  58.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.99 
 
 
288 aa  58.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  31.88 
 
 
149 aa  58.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  37.66 
 
 
296 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  35.46 
 
 
320 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 
314 aa  58.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  33.56 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  31.37 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  27.85 
 
 
177 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  40.24 
 
 
303 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 
172 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  29.17 
 
 
276 aa  57.8  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  28.17 
 
 
288 aa  57.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  30.82 
 
 
282 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  32.61 
 
 
300 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  29.5 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  31.91 
 
 
289 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  43.08 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.88 
 
 
180 aa  57.8  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  33.08 
 
 
305 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  27.74 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.17 
 
 
169 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
294 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  27.27 
 
 
151 aa  57  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  30.67 
 
 
148 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  43.53 
 
 
280 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  29.86 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  29.45 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  33.81 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  35.14 
 
 
280 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  33.06 
 
 
162 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  31.47 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  31.82 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  27.86 
 
 
212 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  30.14 
 
 
144 aa  57  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  31.33 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  50.94 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  32.86 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>