46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2635 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2635  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  457  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352315  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  30.93 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  34.06 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1647  hypothetical protein  28.46 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.042207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1295  hypothetical protein  32.23 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  29.15 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1085  putative transmembrane protein  30.65 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3700  hypothetical protein  29.64 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.677468  normal  0.239626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  30.08 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1332  hypothetical protein  34.98 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  29.3 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  27.83 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2576  putative transmembrane protein  29.61 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2172  hypothetical protein  29.61 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0088  hypothetical protein  30.04 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  28.26 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2362  hypothetical protein  31.38 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5289  putative transmembrane protein  27.78 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  30.71 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3537  hypothetical protein  29.22 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  28.27 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0288  Anti-sigma-K factor RskA  25.35 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0073  hypothetical protein  29.74 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1695  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  29.13 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0461  hypothetical protein  27.56 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0400  uncharacterized protein-like protein  28.39 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0972  hypothetical protein  27.12 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3747  hypothetical protein  24.68 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831367  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01570  hypothetical protein  40 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  27.89 
 
 		 246 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  24.89 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3056  hypothetical protein  27.97 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  24.89 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0076  hypothetical protein  28.82 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3920  uncharacterized protein-like protein  32.74 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00106031  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1826  hypothetical protein  25.83 
 
 		 315 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0616664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3808  RNA polymerase sigma-70 family protein  25.94 
 
 		 248 aa  48.5  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178048  normal  0.362907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4257  uncharacterized protein-like protein  26.56 
 
 		 259 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3889  uncharacterized protein-like protein  25.88 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6529  hypothetical protein  54.76 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2488  hypothetical protein  25.11 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101842 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01781  hypothetical protein  24.38 
 
 		 277 aa  45.4  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00553  hypothetical protein  30.6 
 
 		 253 aa  45.1  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4227  hypothetical protein  23.96 
 
 		 294 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1097  hypothetical protein  23.98 
 
 		 254 aa  43.5  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>