More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2598 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2598  trypsin family protein  100 
 
 		 344 aa  669    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.7222  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4143  trypsin family protein  40.13 
 
 		 349 aa  227  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483175  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  39.05 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.65 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.09 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  36.62 
 
 		 487 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  34.04 
 
 		 374 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  36.28 
 
 		 418 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  33.07 
 
 		 464 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  39.25 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  33.02 
 
 		 488 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  33.6 
 
 		 476 aa  169  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  33.64 
 
 		 379 aa  170  4e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  38.51 
 
 		 400 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  35.19 
 
 		 477 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  32.11 
 
 		 474 aa  169  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  33.33 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  36.42 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  32.11 
 
 		 474 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  34.1 
 
 		 472 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  36.27 
 
 		 487 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  33.94 
 
 		 474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  33.95 
 
 		 473 aa  167  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  34.88 
 
 		 492 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  34.15 
 
 		 516 aa  166  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  34.41 
 
 		 477 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  38.7 
 
 		 496 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0128  protease Do  32.25 
 
 		 474 aa  166  8e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.445461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  36.86 
 
 		 482 aa  165  9e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  34.88 
 
 		 479 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  34.41 
 
 		 499 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  32.35 
 
 		 456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  38.62 
 
 		 496 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  35.1 
 
 		 514 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  36.52 
 
 		 513 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  33.64 
 
 		 492 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  33.64 
 
 		 492 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  38.36 
 
 		 501 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  34.38 
 
 		 458 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  38.36 
 
 		 503 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  38.62 
 
 		 496 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  38.36 
 
 		 503 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  33.43 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  35.84 
 
 		 528 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  31.19 
 
 		 479 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  34.66 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  36.99 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  41.67 
 
 		 498 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  34.41 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  36.08 
 
 		 501 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  34.01 
 
 		 425 aa  160  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  32.87 
 
 		 493 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  31.09 
 
 		 493 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  37.5 
 
 		 469 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  32.87 
 
 		 506 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  40.89 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  33.06 
 
 		 523 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  34.1 
 
 		 511 aa  160  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  33.52 
 
 		 455 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  34.15 
 
 		 389 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  32.71 
 
 		 464 aa  159  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 		 523 aa  159  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  33.75 
 
 		 457 aa  159  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  32.24 
 
 		 461 aa  159  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  35.97 
 
 		 496 aa  159  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  33.13 
 
 		 490 aa  159  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  30.51 
 
 		 481 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  34.99 
 
 		 501 aa  159  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  36.1 
 
 		 508 aa  159  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  32.97 
 
 		 505 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  33.33 
 
 		 457 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  32.78 
 
 		 462 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  34.04 
 
 		 478 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  33.33 
 
 		 457 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  32.87 
 
 		 493 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  33.33 
 
 		 463 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  34.17 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  35.28 
 
 		 482 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  32.29 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  33.33 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  33.62 
 
 		 491 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  34.07 
 
 		 500 aa  157  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  32.49 
 
 		 456 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  30.53 
 
 		 491 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  33.14 
 
 		 455 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  36.3 
 
 		 476 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  36.3 
 
 		 476 aa  156  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  32.57 
 
 		 502 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0618  hypothetical protein  33.79 
 
 		 503 aa  156  6e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  34.29 
 
 		 505 aa  156  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  36.62 
 
 		 504 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  36.55 
 
 		 504 aa  156  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  36 
 
 		 480 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  34.03 
 
 		 467 aa  155  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  34.06 
 
 		 464 aa  155  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  34.56 
 
 		 523 aa  155  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  31.84 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  36.27 
 
 		 498 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  35.05 
 
 		 527 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  35.4 
 
 		 527 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>