126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2585 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2585  putative signal transduction protein  100 
 
 		 332 aa  655    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0032  putative signal transduction protein  38.73 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 324 aa  86.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2952  putative signal transduction protein  29.65 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.281688  normal  0.0690285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0005  putative signal transduction protein  28.45 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373694  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0011  putative signal transduction protein  28.02 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  28.14 
 
 		 718 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0011  putative signal transduction protein  27.9 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000619076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0007  putative signal transduction protein  27.59 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0011  putative signal transduction protein  27.16 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0123691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  26.72 
 
 		 266 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  32.68 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  29.09 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0005  metal dependent phosphohydrolase  23.4 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387927  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  25.37 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  30.34 
 
 		 730 aa  63.5  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  29.09 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3052  putative signal transduction protein  27.6 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  29.09 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0007  putative signal transduction protein  26.34 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000736166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  32.62 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  26.83 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0005  metal dependent phosphohydrolase  26.98 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0007  putative signal transduction protein  25.95 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0608223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0015  putative signal transduction protein  25.95 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189797 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0024  putative signal transduction protein  29.1 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  28.97 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  23.58 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  32.62 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  26.32 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0013  putative signal transduction protein  25.83 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000360962 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  29.45 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  30.14 
 
 		 289 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0011  putative signal transduction protein  23.42 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000072807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  26.54 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  26.54 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  29.45 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  21.3 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1904  putative signal transduction protein  26.24 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  27.07 
 
 		 406 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  29.9 
 
 		 397 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  26.34 
 
 		 280 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  27.66 
 
 		 274 aa  54.3  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  24.41 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  27.34 
 
 		 274 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  27.34 
 
 		 274 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  27.34 
 
 		 274 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  27.34 
 
 		 274 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  24.51 
 
 		 287 aa  53.9  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  28.87 
 
 		 277 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  31.34 
 
 		 724 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  29.71 
 
 		 279 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  27.66 
 
 		 274 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  27.66 
 
 		 274 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  27.66 
 
 		 274 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 		 440 aa  53.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1104  metal dependent phosphohydrolase  29.23 
 
 		 371 aa  53.1  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  25.39 
 
 		 279 aa  52.8  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  25.16 
 
 		 274 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2515  putative signal transduction protein  26.26 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  23.27 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  26.28 
 
 		 275 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  28.93 
 
 		 274 aa  50.8  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1912  hypothetical protein  31.53 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213081  normal  0.293367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  24.69 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 		 378 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  27.14 
 
 		 650 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  24.58 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1708  putative signal transduction protein  32 
 
 		 274 aa  49.7  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.538449  normal  0.498965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  32 
 
 		 274 aa  49.7  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3312  hypothetical protein  24.63 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0557  Metal-dependent hydrolase HDOD  30 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.681688  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  25.56 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  25 
 
 		 284 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  30.28 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  24.19 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  28.67 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  26.27 
 
 		 284 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 		 544 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  27.56 
 
 		 280 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  23.53 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4198  putative signal transduction protein  27.18 
 
 		 288 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  24.65 
 
 		 275 aa  47.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  26 
 
 		 373 aa  47  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1203  response regulator  24.71 
 
 		 634 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  28 
 
 		 288 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  22.73 
 
 		 288 aa  46.6  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3190  diguanylate cyclase  37.33 
 
 		 852 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 		 408 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  28.86 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  26.21 
 
 		 275 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  28.03 
 
 		 716 aa  46.2  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  20.22 
 
 		 281 aa  46.2  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.1 
 
 		 412 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>