174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2580 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2580  glucan biosynthesis protein D  100 
 
 		 529 aa  1067    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1670  glucan biosynthesis protein G  61 
 
 		 498 aa  598  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  43.96 
 
 		 514 aa  402  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  39.56 
 
 		 517 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  39.56 
 
 		 517 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  39.56 
 
 		 517 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  39.56 
 
 		 517 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  39.56 
 
 		 517 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  39.13 
 
 		 511 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  39.13 
 
 		 511 aa  396  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  39.13 
 
 		 517 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  39.13 
 
 		 511 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  39.13 
 
 		 517 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  40.24 
 
 		 511 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  39.13 
 
 		 511 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  39.13 
 
 		 511 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  39.13 
 
 		 517 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  40.24 
 
 		 528 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  39.13 
 
 		 511 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  40.27 
 
 		 522 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  40.87 
 
 		 511 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  40.78 
 
 		 597 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  40.49 
 
 		 525 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  40 
 
 		 522 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  39.26 
 
 		 533 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  41.32 
 
 		 533 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  39.13 
 
 		 522 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  40.04 
 
 		 604 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  40.04 
 
 		 604 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  40.04 
 
 		 558 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  40.61 
 
 		 594 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  40.3 
 
 		 525 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0439  glucan biosynthesis protein G  39.61 
 
 		 579 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529505  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  42.18 
 
 		 504 aa  385  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  42.18 
 
 		 520 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  41.12 
 
 		 588 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  42.18 
 
 		 530 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  39.41 
 
 		 579 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  39.04 
 
 		 522 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  40.37 
 
 		 559 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  39.42 
 
 		 604 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  40.42 
 
 		 562 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  40.42 
 
 		 562 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  40.42 
 
 		 608 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  40.42 
 
 		 562 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5162  periplasmic glucan biosynthesis protein  40.7 
 
 		 641 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1116  glucan biosynthesis protein G  42.2 
 
 		 541 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5076  glucan biosynthesis protein G  39.75 
 
 		 559 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  39.05 
 
 		 522 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  39.76 
 
 		 642 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  38.66 
 
 		 522 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  42.62 
 
 		 525 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  42.95 
 
 		 498 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  39.8 
 
 		 505 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  40.45 
 
 		 568 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0582  glucan biosynthesis protein G  38.35 
 
 		 535 aa  368  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3996  glucan biosynthesis protein G  36.47 
 
 		 536 aa  365  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00021174  normal  0.469553 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  39.18 
 
 		 546 aa  360  4e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  40.67 
 
 		 517 aa  359  8e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1285  glucan biosynthesis protein G  36.66 
 
 		 519 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2785  glucan biosynthesis protein G  41.06 
 
 		 522 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  41.14 
 
 		 534 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  41.44 
 
 		 519 aa  352  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  40.86 
 
 		 530 aa  351  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0960  glucan biosynthesis protein D  37.82 
 
 		 514 aa  347  4e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1075  glucan biosynthesis protein D  37.82 
 
 		 514 aa  347  4e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3377  glucan biosynthesis protein G  41.09 
 
 		 527 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  42.18 
 
 		 542 aa  343  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  41.82 
 
 		 528 aa  342  8e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1794  glucan biosynthesis protein G  41.57 
 
 		 514 aa  340  5e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.051512  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  40.95 
 
 		 532 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1081  glucan biosynthesis protein G  39.46 
 
 		 533 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.418062  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  38.65 
 
 		 545 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  38.65 
 
 		 545 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  38.85 
 
 		 498 aa  333  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  38.65 
 
 		 545 aa  333  4e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  38.43 
 
 		 540 aa  333  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  38.9 
 
 		 545 aa  333  5e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  37.58 
 
 		 534 aa  332  8e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  38.65 
 
 		 503 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1534  glucan biosynthesis protein G  39.38 
 
 		 508 aa  331  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  36.96 
 
 		 534 aa  330  5.0000000000000004e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  38.98 
 
 		 551 aa  329  8e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  37.86 
 
 		 542 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  37.86 
 
 		 542 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  37.86 
 
 		 542 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  37.86 
 
 		 542 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  37.5 
 
 		 559 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  44.42 
 
 		 560 aa  326  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  39.28 
 
 		 537 aa  326  6e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  41.01 
 
 		 503 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3081  glucan biosynthesis protein G  41.87 
 
 		 558 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1158  glucan biosynthesis protein G  39.79 
 
 		 527 aa  325  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  37.63 
 
 		 534 aa  324  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  39.16 
 
 		 534 aa  325  2e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2731  glucan biosynthesis protein G  35.09 
 
 		 528 aa  323  4e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2336  glucan biosynthesis protein G  34.7 
 
 		 529 aa  323  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  40.8 
 
 		 495 aa  322  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2674  glucan biosynthesis protein D  35.8 
 
 		 527 aa  323  7e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0237308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3126  glucan biosynthesis protein G  37.89 
 
 		 525 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.213498  normal  0.0516686 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>