103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2570 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  100 
 
 
187 aa  386  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  68.11 
 
 
193 aa  267  7e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  68.33 
 
 
189 aa  266  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  54.4 
 
 
186 aa  203  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  48.88 
 
 
189 aa  185  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  47.31 
 
 
202 aa  180  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  45.16 
 
 
185 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  43.02 
 
 
202 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  45.45 
 
 
199 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  41.44 
 
 
187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  33.71 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  36.99 
 
 
206 aa  119  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  35.47 
 
 
185 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  29.48 
 
 
187 aa  98.6  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  33.52 
 
 
190 aa  97.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  32.57 
 
 
179 aa  95.1  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  38.4 
 
 
147 aa  93.2  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  32.03 
 
 
184 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  32.03 
 
 
184 aa  92  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  40.52 
 
 
177 aa  92  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  32.03 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  32.03 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  32.03 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  33.76 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  31.52 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  44.55 
 
 
190 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  31.52 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  30.06 
 
 
180 aa  84.7  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  33.33 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  31.01 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  31.21 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  30.61 
 
 
148 aa  79  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  29.05 
 
 
181 aa  79  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  42.24 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  35.09 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  39.29 
 
 
159 aa  77.4  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  29.88 
 
 
163 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  34.19 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  40 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  34.48 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  41.03 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  35.65 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  29.33 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  31.5 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  32.47 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  37.5 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  35.59 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  40.17 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  28.08 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  33.91 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  38.18 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  31.97 
 
 
156 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  29.67 
 
 
176 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0862  OsmC family protein  27.44 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219925  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  31.53 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  32.74 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  36.96 
 
 
169 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  32.14 
 
 
187 aa  62  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  27.61 
 
 
185 aa  62  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  28.17 
 
 
151 aa  62  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  31.53 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  35.23 
 
 
169 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  34.02 
 
 
168 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  34.04 
 
 
168 aa  57  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  30.61 
 
 
142 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  32.41 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  29.7 
 
 
142 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  32.97 
 
 
169 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  30.61 
 
 
142 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  30.61 
 
 
142 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  32.95 
 
 
169 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  31.09 
 
 
142 aa  54.7  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  32.95 
 
 
169 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  31.19 
 
 
169 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3495  hypothetical protein  29.59 
 
 
142 aa  53.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  27.67 
 
 
200 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  31.82 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  32.95 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  30.7 
 
 
138 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  28.71 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1145  OsmC family protein  26.28 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.354032  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0684  OsmC-like protein  36.9 
 
 
167 aa  48.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.503679  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  27.37 
 
 
188 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2206  OsmC family protein  29.79 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.742376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0031  OsmC-like protein  37.31 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1311  OsmC family protein  27.34 
 
 
169 aa  46.2  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.474766  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0218  hypothetical protein  40.91 
 
 
74 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2892  OsmC family protein  38.81 
 
 
169 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  34.65 
 
 
169 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  33.66 
 
 
170 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  23.66 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3648  OsmC family protein  26.13 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1163  OsmC family protein  31.62 
 
 
143 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000507704 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  28.57 
 
 
129 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2578  OsmC family protein  32.58 
 
 
142 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  28.04 
 
 
138 aa  42.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  34.33 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  27.73 
 
 
176 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  27.73 
 
 
176 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  27.73 
 
 
176 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.360981 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>