257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2475 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2475  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
385 aa  792    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  46.28 
 
 
384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  33.03 
 
 
766 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  31.92 
 
 
412 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  33.41 
 
 
437 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  30.75 
 
 
416 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.75 
 
 
416 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  33.18 
 
 
437 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  29.7 
 
 
417 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  32.08 
 
 
433 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  31.95 
 
 
439 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  32.95 
 
 
468 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  30.97 
 
 
444 aa  162  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  32.27 
 
 
446 aa  162  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  31.22 
 
 
442 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  30.37 
 
 
444 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  31.62 
 
 
442 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  33.87 
 
 
447 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  33.07 
 
 
409 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  32.63 
 
 
416 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  32.24 
 
 
427 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  31.98 
 
 
438 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  30.26 
 
 
446 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  31.79 
 
 
429 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  33.25 
 
 
386 aa  150  5e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  30.32 
 
 
436 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  30.32 
 
 
436 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  30.32 
 
 
436 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  32.53 
 
 
425 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  34.13 
 
 
428 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  32.34 
 
 
393 aa  146  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  30.71 
 
 
429 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  32.66 
 
 
420 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  28.48 
 
 
432 aa  143  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  32.24 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  31.33 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  30.95 
 
 
419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  32.75 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  31.57 
 
 
417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  31.07 
 
 
437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  31.25 
 
 
434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  31.19 
 
 
412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  33.25 
 
 
430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0356  protein of unknown function DUF323  31.62 
 
 
418 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.199231  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  29.87 
 
 
385 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  33.24 
 
 
374 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  32.41 
 
 
420 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  35.9 
 
 
398 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  31.73 
 
 
422 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  34.69 
 
 
506 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  31.67 
 
 
423 aa  138  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  30.82 
 
 
434 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  37.55 
 
 
419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  31.9 
 
 
418 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  32.42 
 
 
420 aa  136  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  29.9 
 
 
437 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  31.81 
 
 
459 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  31.08 
 
 
448 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  32.29 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  29.98 
 
 
487 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  29.44 
 
 
426 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  28.42 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0951  hypothetical protein  40.55 
 
 
432 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  28.11 
 
 
386 aa  134  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1379  hypothetical protein  34.31 
 
 
426 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  31.62 
 
 
415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  28.76 
 
 
383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  31.49 
 
 
415 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  26.87 
 
 
446 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1756  hypothetical protein  38.3 
 
 
420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  31.35 
 
 
429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  30.56 
 
 
425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  29.77 
 
 
428 aa  130  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  30.08 
 
 
395 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  30.3 
 
 
434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  28.3 
 
 
437 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  32.17 
 
 
430 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  29.34 
 
 
441 aa  130  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  25.8 
 
 
436 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  30.72 
 
 
453 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  31.75 
 
 
723 aa  129  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  40.1 
 
 
415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  31.4 
 
 
453 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  32.07 
 
 
404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  31.62 
 
 
374 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  29.71 
 
 
470 aa  127  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1506  hypothetical protein  41.15 
 
 
433 aa  126  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  27.32 
 
 
427 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  27.31 
 
 
425 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  30.79 
 
 
412 aa  123  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  31.82 
 
 
374 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3660  protein of unknown function DUF323  32.63 
 
 
418 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  30.16 
 
 
442 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  33.72 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  32.17 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  33.22 
 
 
432 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0822  protein of unknown function DUF323  38.71 
 
 
432 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0893  protein of unknown function DUF323  38.71 
 
 
432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  30.09 
 
 
429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>