More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2465 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
300 aa  621  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  72.67 
 
 
304 aa  438  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  69.23 
 
 
304 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  66.33 
 
 
302 aa  431  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  70.43 
 
 
298 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  69.23 
 
 
306 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  68.23 
 
 
303 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  66.89 
 
 
301 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  67.22 
 
 
305 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  67.56 
 
 
305 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  65.89 
 
 
307 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  68.23 
 
 
306 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  67.68 
 
 
300 aa  411  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  63.55 
 
 
306 aa  414  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  68.23 
 
 
306 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  67.56 
 
 
306 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  65.89 
 
 
306 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  63.67 
 
 
306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  67 
 
 
303 aa  404  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  63.33 
 
 
306 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  62.54 
 
 
305 aa  404  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  64.88 
 
 
304 aa  401  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  61.2 
 
 
307 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  64 
 
 
311 aa  395  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  64.55 
 
 
312 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  62.88 
 
 
308 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  64 
 
 
311 aa  395  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  58.77 
 
 
320 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  60.67 
 
 
305 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  58.86 
 
 
311 aa  374  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  59.4 
 
 
309 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  58 
 
 
306 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  57.72 
 
 
329 aa  368  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  58.61 
 
 
305 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  58.61 
 
 
305 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  59.2 
 
 
309 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  59.53 
 
 
309 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  57.33 
 
 
303 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  59.2 
 
 
309 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  59.2 
 
 
309 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  58.8 
 
 
303 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  58.53 
 
 
309 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  58.53 
 
 
309 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  58.53 
 
 
309 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  58.53 
 
 
309 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  58.53 
 
 
309 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  58.53 
 
 
309 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  58.53 
 
 
309 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  56.67 
 
 
303 aa  363  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  58.86 
 
 
309 aa  362  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  58.86 
 
 
309 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  56.11 
 
 
315 aa  361  8e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  58.86 
 
 
309 aa  361  9e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  58.33 
 
 
305 aa  360  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  59.2 
 
 
306 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  57.72 
 
 
302 aa  359  3e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  57.1 
 
 
310 aa  358  5e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  58.39 
 
 
307 aa  358  6e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  57.47 
 
 
320 aa  358  6e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  58.19 
 
 
309 aa  358  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  56.71 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  57.53 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  58.86 
 
 
560 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  58.14 
 
 
305 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  58.39 
 
 
305 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1709  ornithine carbamoyltransferase  57 
 
 
306 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00976675  hitchhiker  0.00312362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3205  ornithine carbamoyltransferase  57.86 
 
 
309 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.820291  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  57.48 
 
 
303 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1042  ornithine carbamoyltransferase  56 
 
 
329 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.246407  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  57.1 
 
 
309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  59.34 
 
 
321 aa  355  3.9999999999999996e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  56.04 
 
 
308 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  58.05 
 
 
326 aa  352  5e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  57.72 
 
 
326 aa  350  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2424  ornithine carbamoyltransferase  56.86 
 
 
308 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  59.14 
 
 
309 aa  348  4e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  56 
 
 
303 aa  348  6e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2830  ornithine carbamoyltransferase  56.52 
 
 
308 aa  348  6e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.998909  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2554  ornithine carbamoyltransferase  56.52 
 
 
308 aa  347  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0520201  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  55.33 
 
 
309 aa  346  3e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2902  ornithine carbamoyltransferase  56.38 
 
 
307 aa  345  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.674769  normal  0.667761 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  55.67 
 
 
302 aa  345  5e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  52.79 
 
 
307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 
320 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  52.48 
 
 
313 aa  333  3e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  54.52 
 
 
303 aa  332  6e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  54.67 
 
 
302 aa  331  7.000000000000001e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  52.96 
 
 
314 aa  330  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  52.82 
 
 
312 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  53.09 
 
 
355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  52.84 
 
 
303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 
312 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  58.14 
 
 
309 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  58.14 
 
 
309 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2691  ornithine carbamoyltransferase  58.14 
 
 
309 aa  325  7e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.661116  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  51.83 
 
 
301 aa  323  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  53.49 
 
 
308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  51.15 
 
 
305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3276  ornithine carbamoyltransferase  55 
 
 
308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0643  ornithine carbamoyltransferase  53 
 
 
308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>