35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2394 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  100 
 
 		 525 aa  1045    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  26.37 
 
 		 510 aa  137  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  26.16 
 
 		 529 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  27.57 
 
 		 536 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  27.29 
 
 		 524 aa  124  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  24.51 
 
 		 508 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  24.75 
 
 		 516 aa  111  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  23.98 
 
 		 505 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  25 
 
 		 514 aa  108  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  27.25 
 
 		 528 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  22.24 
 
 		 496 aa  100  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  25.24 
 
 		 530 aa  99.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  27.45 
 
 		 523 aa  96.3  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  28.11 
 
 		 515 aa  90.1  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  23.2 
 
 		 497 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  26.04 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  21.51 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  26.85 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  23.57 
 
 		 526 aa  65.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  21.67 
 
 		 520 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  22.66 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  23.72 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  24.14 
 
 		 533 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  21.77 
 
 		 534 aa  59.3  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  25.39 
 
 		 485 aa  58.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  24.74 
 
 		 516 aa  57.4  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  25.37 
 
 		 522 aa  54.7  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  23.83 
 
 		 277 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  25.32 
 
 		 295 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  28.65 
 
 		 312 aa  47  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  25.13 
 
 		 281 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  26.74 
 
 		 309 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  30.61 
 
 		 213 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  30.09 
 
 		 315 aa  45.4  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0005  eight transmembrane protein EpsH, putative  25.6 
 
 		 245 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>