141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2244 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2244  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2091  hypothetical protein  35.34 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1039  LysM domain-containing protein  39.76 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000199986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1323  Peptidoglycan-binding LysM  41.98 
 
 		 230 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.6395e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2902  Peptidoglycan-binding LysM  42.35 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000393442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1464  LysM domain-containing protein  43.66 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.026138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1358  peptidoglycan-binding LysM  44.29 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000598649  hitchhiker  5.9516e-20 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0972  peptidoglycan-binding LysM  45.95 
 
 		 546 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  35.71 
 
 		 387 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  48.05 
 
 		 663 aa  58.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  55.56 
 
 		 1051 aa  57.4  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1930  peptidoglycan-binding LysM  50.98 
 
 		 503 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0490055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4742  peptidoglycan-binding LysM  43.28 
 
 		 511 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5209  Peptidoglycan-binding LysM  43.28 
 
 		 511 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.263437 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  37.97 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1623  Peptidoglycan-binding LysM  35.92 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000375126  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2688  peptidoglycan-binding LysM  45.16 
 
 		 361 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00047104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  50.98 
 
 		 405 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  51.06 
 
 		 349 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5282  Peptidoglycan-binding LysM  45.45 
 
 		 552 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.772795 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2006  Peptidoglycan-binding LysM  41.82 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899391  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  39.29 
 
 		 350 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  42.62 
 
 		 651 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0818  hypothetical protein  45.76 
 
 		 623 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1406  cation transport ATPase  41.38 
 
 		 1082 aa  52.4  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  49.02 
 
 		 360 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  47.06 
 
 		 395 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2328  peptidoglycan-binding LysM  40.3 
 
 		 234 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000346433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2195  peptidoglycan-binding LysM  40.58 
 
 		 238 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000396131  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  47.06 
 
 		 364 aa  51.2  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  40.74 
 
 		 341 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3586  peptidoglycan-binding LysM  43.86 
 
 		 352 aa  50.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0589826  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1910  peptidoglycan-binding LysM  36.17 
 
 		 382 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  43.08 
 
 		 390 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1636  Peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 		 451 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  36.36 
 
 		 228 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 428 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  39.02 
 
 		 341 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1869  peptidoglycan-binding LysM  37.97 
 
 		 367 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0441  LysM domain-containing protein  50 
 
 		 404 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21565  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  33.96 
 
 		 409 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  47.06 
 
 		 346 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1112  peptidoglycan-binding LysM  48.84 
 
 		 322 aa  48.5  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  40.91 
 
 		 1910 aa  48.5  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  39.02 
 
 		 341 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  43.55 
 
 		 388 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0991  peptidoglycan-binding LysM  51.16 
 
 		 339 aa  48.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0156975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  41.82 
 
 		 185 aa  48.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0448  LysM domain-containing protein  50 
 
 		 404 aa  48.1  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  52.17 
 
 		 572 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  33.91 
 
 		 420 aa  47.4  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  36 
 
 		 349 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  36 
 
 		 349 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0302  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.82 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 		 394 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  37.25 
 
 		 343 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2695  peptidoglycan-binding protein  41.67 
 
 		 440 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2211  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.45 
 
 		 500 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00497018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  37.84 
 
 		 341 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 338 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  40.35 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1352  peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 		 440 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.47776  normal  0.0441198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  40 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  37.84 
 
 		 341 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0939  peptidoglycan-binding LysM  40.54 
 
 		 309 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.013426  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 338 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  37.29 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  44.23 
 
 		 417 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  36.36 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  36.36 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  42.86 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  40.96 
 
 		 440 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  44.23 
 
 		 419 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  47.83 
 
 		 352 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 		 408 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0917  LysM domain/BON superfamily protein  40 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  44.23 
 
 		 426 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  40.96 
 
 		 440 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0051  peptidoglycan-binding LysM  34.41 
 
 		 436 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.492826  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  36.36 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  42.62 
 
 		 391 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  45.1 
 
 		 368 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0952  LysM domain/BON superfamily protein  40 
 
 		 167 aa  44.3  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954636  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3013  peptidoglycan-binding LysM  48.89 
 
 		 345 aa  44.3  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1766  hypothetical protein  40 
 
 		 531 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.905557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  36.49 
 
 		 345 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4943  LysM domain/BON superfamily protein  42.86 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  39.76 
 
 		 440 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  49.06 
 
 		 359 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 		 369 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  36.07 
 
 		 546 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  33.93 
 
 		 403 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5181  LysM domain/BON superfamily protein  34.48 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.556952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2152  Peptidoglycan-binding LysM  31.82 
 
 		 334 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 		 97 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  43.14 
 
 		 256 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  38.6 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  41.18 
 
 		 362 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  38.18 
 
 		 242 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 		 367 aa  42.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>