45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2204 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  100 
 
 		 383 aa  807    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  88.74 
 
 		 390 aa  728    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  77.51 
 
 		 378 aa  632  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  77.51 
 
 		 378 aa  632  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0592  Radical SAM domain protein  51.38 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000649486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  45.04 
 
 		 349 aa  309  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1558  radical SAM domain-containing protein  35.5 
 
 		 355 aa  227  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0417812 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  34.75 
 
 		 366 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  34.17 
 
 		 351 aa  216  7e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0912  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0705  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1520  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 266 aa  95.5  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0681  radical SAM domain-containing protein  24.01 
 
 		 283 aa  93.2  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0962  radical SAM domain-containing protein  22.57 
 
 		 290 aa  92  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  24.2 
 
 		 296 aa  85.9  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  22.45 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  22.97 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  21.54 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  22.18 
 
 		 356 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  22.18 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  32.69 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  22.3 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  23.31 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  23.41 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  22.97 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  22.93 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  22.92 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  22.13 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 		 351 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  22.92 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  21.29 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  21.61 
 
 		 320 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  21 
 
 		 362 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  22.83 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  24.06 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  21.72 
 
 		 322 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  23.04 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.06 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  23.2 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.78 
 
 		 321 aa  42.7  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>