38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2191 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 
249 aa  498  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  70.66 
 
 
255 aa  295  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  64.05 
 
 
244 aa  276  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  58.37 
 
 
248 aa  251  6e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  54.67 
 
 
233 aa  231  9e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  36.4 
 
 
332 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  34.67 
 
 
334 aa  152  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  35.02 
 
 
333 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  36.23 
 
 
330 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  36.88 
 
 
335 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  33.84 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  35.23 
 
 
342 aa  145  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  35.36 
 
 
337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  35.66 
 
 
339 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  34.81 
 
 
330 aa  142  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  33.94 
 
 
334 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  32.7 
 
 
331 aa  129  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  33.82 
 
 
331 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  33.08 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  33.33 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  33.84 
 
 
331 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  30.88 
 
 
332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  35.84 
 
 
271 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  29.23 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  31.62 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  33.03 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  29.06 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0338  nitrate reductase gamma subunit  25.98 
 
 
302 aa  60.8  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0229236 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  26.7 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.862434 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  24.64 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  25.6 
 
 
277 aa  52.8  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1445  nitrate reductase, gamma subunit  25.86 
 
 
302 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0248  Nitrate reductase gamma subunit  24.02 
 
 
299 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0778  nitrate reductase gamma subunit  28.29 
 
 
225 aa  47  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.379399  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.06 
 
 
234 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0608  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.84 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  23.11 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  24.84 
 
 
261 aa  42.7  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>