43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2172 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  255  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  42.98 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  42.53 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  43.68 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  37.5 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  31.43 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 240 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  39.29 
 
 		 240 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  39.29 
 
 		 240 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  38.2 
 
 		 221 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 221 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  37.08 
 
 		 216 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  37.08 
 
 		 216 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 229 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  35.96 
 
 		 216 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 209 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  40.48 
 
 		 235 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 228 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  32.32 
 
 		 217 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  30 
 
 		 231 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  30 
 
 		 237 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  34.88 
 
 		 232 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  38.1 
 
 		 221 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 222 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  36.9 
 
 		 218 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 229 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3556  repressor protein CI  29.21 
 
 		 235 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.860167  hitchhiker  9.00539e-18 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 240 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  32.94 
 
 		 243 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  32.94 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  48.98 
 
 		 223 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  32.94 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  37.65 
 
 		 210 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  32.98 
 
 		 224 aa  41.6  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  36.47 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  35.29 
 
 		 210 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  31.25 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  31.4 
 
 		 229 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  35.29 
 
 		 210 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  31.4 
 
 		 215 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  33.33 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  32.93 
 
 		 224 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>