More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2125 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  100 
 
 
286 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  56.94 
 
 
291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  44.25 
 
 
287 aa  246  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  43.55 
 
 
287 aa  240  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  46.39 
 
 
289 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  46.76 
 
 
289 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  41.81 
 
 
287 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  45.52 
 
 
289 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  42.96 
 
 
290 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  44.48 
 
 
290 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  44.33 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  44.48 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  44.25 
 
 
290 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  44.1 
 
 
290 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  43.55 
 
 
290 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  40.77 
 
 
287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  42.76 
 
 
290 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  41.28 
 
 
280 aa  199  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  42.24 
 
 
274 aa  199  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  38.16 
 
 
287 aa  199  6e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  37.23 
 
 
285 aa  189  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  38.87 
 
 
289 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  35.31 
 
 
269 aa  187  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  36.68 
 
 
289 aa  182  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  36.68 
 
 
289 aa  182  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  37.5 
 
 
286 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  37.17 
 
 
302 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  39.5 
 
 
282 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  36.84 
 
 
302 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  39.29 
 
 
280 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  38.89 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  37.99 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  37.05 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  37.63 
 
 
282 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  37.63 
 
 
282 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  37.05 
 
 
281 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  36.18 
 
 
302 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  38.33 
 
 
286 aa  169  4e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  37.89 
 
 
282 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  37.24 
 
 
284 aa  166  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  33.33 
 
 
272 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  37.24 
 
 
284 aa  166  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  37.24 
 
 
284 aa  166  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  37.24 
 
 
284 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  37.24 
 
 
284 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  33.33 
 
 
272 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  34.15 
 
 
287 aa  166  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  35.5 
 
 
330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  37.28 
 
 
285 aa  165  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  35.29 
 
 
285 aa  165  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  36.9 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  36.9 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  36.93 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  36.9 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  37.24 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  36.9 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  35.48 
 
 
310 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  36.33 
 
 
280 aa  161  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  36.9 
 
 
293 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  36.9 
 
 
293 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  36.9 
 
 
293 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  37.41 
 
 
282 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  35.66 
 
 
271 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  36.9 
 
 
293 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  31.72 
 
 
326 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  36.65 
 
 
286 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  36.82 
 
 
282 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  36.82 
 
 
282 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  34.98 
 
 
302 aa  159  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  36.49 
 
 
301 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  36.59 
 
 
285 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  35.21 
 
 
277 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  37.37 
 
 
282 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  36.36 
 
 
293 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  38.83 
 
 
286 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  38.27 
 
 
318 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  38.13 
 
 
282 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  38.13 
 
 
282 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  35.52 
 
 
284 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  36.9 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  33.77 
 
 
324 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  36.49 
 
 
918 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  37.5 
 
 
286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  37.41 
 
 
282 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  35.99 
 
 
289 aa  151  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  35.99 
 
 
289 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  35.99 
 
 
289 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  36.61 
 
 
282 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  34.84 
 
 
293 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  32.52 
 
 
306 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  32.76 
 
 
306 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  33.22 
 
 
334 aa  149  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5272  Thioredoxin domain protein  34.04 
 
 
272 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  31 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  34.14 
 
 
324 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  34.47 
 
 
311 aa  146  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  36.11 
 
 
320 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  33.22 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  34.14 
 
 
286 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1859  thioredoxin domain-containing protein  32.26 
 
 
283 aa  145  9e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal  0.127398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>