More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2009 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 217 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  61.35 
 
 		 216 aa  254  9e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  57.82 
 
 		 221 aa  242  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  56.34 
 
 		 223 aa  234  7e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  54.72 
 
 		 220 aa  231  5e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  53.99 
 
 		 223 aa  228  8e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  52.88 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  48.11 
 
 		 216 aa  221  4.9999999999999996e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  51.4 
 
 		 223 aa  209  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  51.4 
 
 		 223 aa  209  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  50.69 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  52.4 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  51.43 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  51.64 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  49.52 
 
 		 257 aa  198  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  44.65 
 
 		 225 aa  198  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  50.75 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  46.7 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  47.6 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  43.63 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  47.69 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  46.89 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  44.91 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  44.81 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  40.64 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  47.89 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  46.08 
 
 		 222 aa  181  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  46.12 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  47.98 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  41.33 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  43.4 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  43.87 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  39.56 
 
 		 254 aa  164  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.52 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  41.06 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  41.71 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  40.74 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  36.09 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  38.53 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  41.87 
 
 		 225 aa  160  9e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  41.23 
 
 		 221 aa  158  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  36.4 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  46.26 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  34.78 
 
 		 232 aa  155  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  37.08 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  41.15 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  35.55 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.12 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  38.94 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  37.31 
 
 		 216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  36.79 
 
 		 211 aa  131  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  36.79 
 
 		 211 aa  131  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  41.24 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  37.82 
 
 		 221 aa  128  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  38.25 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  40 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  38.42 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  37.43 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  34.31 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  34.31 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  37.26 
 
 		 268 aa  115  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  32.5 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  34.01 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.5 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  35.02 
 
 		 296 aa  111  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  43.04 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  39.59 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  36.65 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  31.5 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.51 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  31.25 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.79 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  27.1 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.03 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.28 
 
 		 236 aa  92.8  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.11 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  30.99 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  30.73 
 
 		 219 aa  89.4  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  31.67 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.5 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.69 
 
 		 240 aa  85.1  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  29.47 
 
 		 224 aa  84.7  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  28.31 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.1 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  27.8 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  28.96 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0873  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.46 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00263227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  30.59 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  27.85 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  28.96 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  29.68 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.68 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.79 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.38 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  28.34 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  28.34 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  29.68 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  27.7 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>