51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1941 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 446 aa  897    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1202  saccharopine dehydrogenase  29.38 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  26.48 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  28.57 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  26.69 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  26.52 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  26.01 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  24.82 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  24.24 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  22.34 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  25.81 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  24.1 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  23.57 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  26.34 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  26.14 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  23.51 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  24 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  25.81 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  25.27 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  23.22 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  24.1 
 
 		 401 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  25.73 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  26.37 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  25.54 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  24.86 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  23.66 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  24.73 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  23.43 
 
 		 409 aa  55.1  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  24.86 
 
 		 403 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  22.56 
 
 		 398 aa  53.5  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  25.25 
 
 		 401 aa  53.5  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  24.73 
 
 		 398 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  26.25 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  26.25 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  25.1 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  22.55 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  24.64 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  26.19 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  26 
 
 		 407 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  25 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  27.44 
 
 		 398 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  24.58 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  24.58 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  23.15 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  25.13 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  27.52 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  22.66 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  24.18 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  23.85 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  28.45 
 
 		 415 aa  43.5  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  26.21 
 
 		 384 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>