275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1727 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  100 
 
 
486 aa  979    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  71.96 
 
 
482 aa  695    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  55.4 
 
 
447 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  54.98 
 
 
461 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  50.59 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  48.83 
 
 
433 aa  395  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  48.43 
 
 
445 aa  398  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  49.17 
 
 
478 aa  388  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  46.23 
 
 
429 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  47.87 
 
 
426 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  47.31 
 
 
447 aa  354  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  43.9 
 
 
447 aa  344  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  47.07 
 
 
490 aa  334  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  44.26 
 
 
444 aa  323  3e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  42.49 
 
 
436 aa  317  4e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  42.14 
 
 
419 aa  300  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  40.76 
 
 
420 aa  297  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  42.26 
 
 
456 aa  294  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  39.35 
 
 
440 aa  290  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  37.18 
 
 
451 aa  263  6.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  41.18 
 
 
419 aa  260  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  41.04 
 
 
419 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  40.6 
 
 
417 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  38.85 
 
 
416 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  38.65 
 
 
436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  37.71 
 
 
413 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  34.2 
 
 
412 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  37.05 
 
 
413 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  37.47 
 
 
420 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  33.73 
 
 
412 aa  230  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  36.82 
 
 
413 aa  229  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  38.72 
 
 
407 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  39.32 
 
 
412 aa  226  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  34.28 
 
 
413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  35.96 
 
 
411 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  37.09 
 
 
414 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  32.8 
 
 
459 aa  220  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  38.97 
 
 
425 aa  219  7e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  34.29 
 
 
411 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  34.76 
 
 
408 aa  216  7e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  35.63 
 
 
405 aa  216  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  35.88 
 
 
428 aa  215  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  37.66 
 
 
415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  35.7 
 
 
418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  31.48 
 
 
445 aa  213  5.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  35.55 
 
 
413 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  35.59 
 
 
391 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  33.82 
 
 
411 aa  207  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  33.73 
 
 
411 aa  206  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  37.5 
 
 
405 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  35.99 
 
 
403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  34.53 
 
 
443 aa  196  6e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  33.18 
 
 
445 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  35.51 
 
 
425 aa  189  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  36.45 
 
 
393 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  35.21 
 
 
461 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  33.25 
 
 
406 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  33.18 
 
 
409 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  32.71 
 
 
426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  31.5 
 
 
430 aa  173  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  32.78 
 
 
438 aa  172  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  30.19 
 
 
426 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  30.99 
 
 
405 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  33.64 
 
 
444 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  31.03 
 
 
431 aa  171  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  29.82 
 
 
441 aa  170  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  33.01 
 
 
409 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  33.01 
 
 
409 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  33.01 
 
 
409 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  34.3 
 
 
440 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  32.34 
 
 
407 aa  164  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  28.08 
 
 
413 aa  163  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31 
 
 
426 aa  162  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.35 
 
 
430 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  30.16 
 
 
431 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  31.07 
 
 
459 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  30.94 
 
 
407 aa  157  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  31.71 
 
 
423 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  32.65 
 
 
455 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  30.66 
 
 
422 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  31.53 
 
 
415 aa  153  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  30 
 
 
428 aa  152  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  33.33 
 
 
421 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  30.77 
 
 
432 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  32.25 
 
 
417 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  32.25 
 
 
417 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  32.25 
 
 
417 aa  151  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  29.95 
 
 
421 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  31.24 
 
 
414 aa  150  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  30.59 
 
 
428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  31.48 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  29.82 
 
 
421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  30.21 
 
 
400 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  30.47 
 
 
412 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  32.4 
 
 
419 aa  146  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  29.86 
 
 
429 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  30.46 
 
 
426 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  29.95 
 
 
407 aa  143  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  30.64 
 
 
408 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  30.64 
 
 
408 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>