More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1698 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2273  glutamate--ammonia ligase  67.79 
 
 		 444 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0123313 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1347  glutamate--ammonia ligase  67.57 
 
 		 444 aa  653    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.353165  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3468  L-glutamine synthetase  67.79 
 
 		 444 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  100 
 
 		 444 aa  927    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2247  glutamine synthetase, type III  68.69 
 
 		 444 aa  651    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238317 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5918  glutamine synthetase, type III  65.77 
 
 		 442 aa  628  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0618649  normal  0.505098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0166  glutamine synthetase, type III  65.91 
 
 		 464 aa  630  1e-179  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3034  glutamate--ammonia ligase  65.15 
 
 		 463 aa  603  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0456  L-glutamine synthetase  63.76 
 
 		 459 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.251652  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2498  L-glutamine synthetase  61.12 
 
 		 446 aa  580  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0717822  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2370  glutamine synthetase, type III  50.69 
 
 		 452 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1911  L-glutamine synthetase  49.77 
 
 		 451 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  0.325105 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1798  glutamate--ammonia ligase  43.72 
 
 		 451 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.44484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0077  L-glutamine synthetase  44.27 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3085  glutamine synthetase, type III  43.5 
 
 		 455 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0794  glutamine synthetase, type III  43.64 
 
 		 461 aa  365  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.827759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2562  L-glutamine synthetase  41.46 
 
 		 452 aa  362  8e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3904  glutamine synthetase, type III  44.55 
 
 		 457 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.157451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1856  L-glutamine synthetase  42.2 
 
 		 453 aa  349  5e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4021  glutamine synthetase, type III  43.41 
 
 		 457 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3726  glutamine synthetase, type III  43.41 
 
 		 457 aa  347  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.681575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4807  glutamine synthetase, type III  42.59 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.602864  normal  0.0371465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4698  glutamine synthetase catalytic region  42.13 
 
 		 453 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1572  glutamine synthetase, type III  43.16 
 
 		 432 aa  342  9e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.49312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1945  L-glutamine synthetase  41.84 
 
 		 432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  0.593814 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1135  glutamate--ammonia ligase  42.06 
 
 		 432 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1659  glutamine synthetase, type III  41.61 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5723  L-glutamine synthetase  42.27 
 
 		 451 aa  335  9e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5344  L-glutamine synthetase  42.27 
 
 		 451 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.567522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5433  L-glutamine synthetase  42.27 
 
 		 451 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.879063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2296  L-glutamine synthetase  41.98 
 
 		 434 aa  330  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2635  glutamine synthetase, type III  40.66 
 
 		 435 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1941  glutamine synthetase, type III  41.84 
 
 		 432 aa  323  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0282  glutamine synthetase, type III  42.25 
 
 		 436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.903176  normal  0.0152238 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1867  glutamine synthetase 3  41.03 
 
 		 438 aa  317  4e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60357 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3525  glutamine synthetase, type III  38.95 
 
 		 480 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0706395 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5752  glutamine synthetase  38.3 
 
 		 435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.23975  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6005  glutamine synthetase catalytic region  38.76 
 
 		 435 aa  305  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0483742  decreased coverage  0.00440887 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6578  glutamine synthetase, type III  37.53 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0536435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4807  glutamine synthetase, type III  39.96 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3294  glutamine synthetase catalytic region  38.89 
 
 		 461 aa  303  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5641  glutamine synthetase, type III  37.3 
 
 		 435 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1300  glutamate--ammonia ligase  38.08 
 
 		 435 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.646608 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1637  glutamine synthetase catalytic region  37.77 
 
 		 458 aa  296  5e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5509  glutamate--ammonia ligase  38.62 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163874 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  37.25 
 
 		 433 aa  292  9e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4892  glutamate--ammonia ligase  38.5 
 
 		 436 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4981  glutamate--ammonia ligase  38.5 
 
 		 436 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5260  glutamate--ammonia ligase  38.5 
 
 		 436 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  38.83 
 
 		 450 aa  286  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1379  glutamine synthetase  36.62 
 
 		 448 aa  286  5e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000272727  hitchhiker  0.00000000000339738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  36.11 
 
 		 446 aa  286  5e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  37.83 
 
 		 444 aa  285  9e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  36.75 
 
 		 456 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  35.89 
 
 		 446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  36.11 
 
 		 446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  38.32 
 
 		 444 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  37.61 
 
 		 444 aa  283  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3145  L-glutamine synthetase  38.03 
 
 		 452 aa  281  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.799755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  36.77 
 
 		 451 aa  281  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  37.44 
 
 		 461 aa  280  3e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  36.64 
 
 		 441 aa  280  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  35.32 
 
 		 443 aa  279  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  36.42 
 
 		 445 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  37.14 
 
 		 445 aa  277  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  38.03 
 
 		 453 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  36.69 
 
 		 442 aa  277  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  37.58 
 
 		 452 aa  276  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  36 
 
 		 442 aa  276  6e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  37.09 
 
 		 444 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  35.25 
 
 		 449 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  35.23 
 
 		 448 aa  273  3e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  38.02 
 
 		 452 aa  274  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  36.85 
 
 		 442 aa  273  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  36.62 
 
 		 456 aa  273  6e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  36.73 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0709  glutamine synthetase, type I  36.56 
 
 		 449 aa  269  7e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  39.01 
 
 		 444 aa  269  7e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2119  glutamine synthetase, type I  37.22 
 
 		 445 aa  269  7e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  35.65 
 
 		 448 aa  269  7e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  36.91 
 
 		 444 aa  269  8.999999999999999e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  34.51 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  36.7 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  37.5 
 
 		 451 aa  268  1e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  35.68 
 
 		 445 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  37.95 
 
 		 453 aa  268  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  36.12 
 
 		 451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  37.11 
 
 		 443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  36.85 
 
 		 442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15270  L-glutamine synthetase  36.1 
 
 		 444 aa  266  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  37.09 
 
 		 441 aa  266  4e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  34.59 
 
 		 447 aa  266  5e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  37.56 
 
 		 444 aa  266  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  36.4 
 
 		 446 aa  266  5.999999999999999e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  36.18 
 
 		 446 aa  266  5.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  36.18 
 
 		 446 aa  266  5.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  38.53 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  37.1 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  35.02 
 
 		 447 aa  265  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  36.55 
 
 		 441 aa  264  3e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>