More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1682 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  100 
 
 
308 aa  618  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4357  transcriptional regulator, LysR family  50.33 
 
 
301 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4627  transcriptional regulator, LysR family  50.67 
 
 
301 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397296  normal  0.257134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1277  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 
299 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.927239  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  43 
 
 
335 aa  247  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
300 aa  246  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  42.42 
 
 
300 aa  240  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
304 aa  239  5e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  41.47 
 
 
301 aa  238  9e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
305 aa  237  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  43.71 
 
 
306 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4262  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294051  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 
298 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
316 aa  231  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 
303 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  39.8 
 
 
307 aa  229  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
295 aa  228  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
299 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
299 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  43.31 
 
 
298 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3528  transcriptional regulator, LysR family  43.49 
 
 
299 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2002  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 
301 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00230596  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 
313 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4604  transcriptional regulator, LysR family  43.49 
 
 
299 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
298 aa  226  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1560  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
307 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.987371  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 
294 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1541  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 
301 aa  225  7e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.827921  normal  0.805114 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  39.43 
 
 
296 aa  225  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3206  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
309 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4684  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.86 
 
 
318 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
309 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  46.39 
 
 
293 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  41.98 
 
 
305 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3571  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 
317 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368621  normal  0.292883 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 
305 aa  223  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 
306 aa  223  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2362  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
301 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  42.72 
 
 
310 aa  223  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.52 
 
 
299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  37.87 
 
 
307 aa  221  8e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  37.87 
 
 
307 aa  221  8e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 
296 aa  221  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  43.94 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  39.65 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  39.65 
 
 
298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 
299 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  39.65 
 
 
298 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.31 
 
 
302 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1915  transcriptional regulator, LysR family  43.05 
 
 
298 aa  218  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 
291 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
305 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  42.41 
 
 
299 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 
294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  39.18 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  40.6 
 
 
298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
298 aa  215  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  37.8 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1689  LysR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1970  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
399 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  41.26 
 
 
301 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0677  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 
299 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1717  LysR family transcriptional regulator  39.48 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4334  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
302 aa  212  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1975  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 
299 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0583  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 
299 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824085  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1356  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 
301 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 
293 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48770  putative transcriptional regulator  41.12 
 
 
304 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120965  hitchhiker  0.00000153166 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
303 aa  210  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4177  transcriptional regulator  40.91 
 
 
304 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5076  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
313 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  41.64 
 
 
301 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  41.39 
 
 
310 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 
298 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3214  transcriptional regulator, LysR family  41.81 
 
 
299 aa  209  7e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397323 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
305 aa  209  7e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
302 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1493  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
313 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
304 aa  208  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2393  transcriptional regulator, LysR family  40.64 
 
 
304 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0137  LysR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
302 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4247  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
297 aa  205  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
292 aa  205  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4932  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
322 aa  205  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  hitchhiker  0.000452081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
301 aa  205  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
303 aa  204  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2812  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 
305 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.110516 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
307 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  37.22 
 
 
304 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  35.07 
 
 
290 aa  203  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
301 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.367716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>