More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1674 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
543 aa  1077  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.8 
 
 
572 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.51 
 
 
573 aa  340  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.02936  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.5 
 
 
573 aa  320  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.13 
 
 
637 aa  320  5e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1249  methyl-accepting chemotaxis protein  36.08 
 
 
596 aa  313  5e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000483868  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1124  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38 
 
 
547 aa  311  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00163985  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.78 
 
 
541 aa  310  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0900  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.68 
 
 
573 aa  306  7e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.476047  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.06 
 
 
549 aa  304  3e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.93 
 
 
679 aa  304  3e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.43 
 
 
552 aa  303  5e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.42 
 
 
541 aa  303  5e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.99 
 
 
541 aa  302  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3979  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.75 
 
 
552 aa  297  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.594367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.75 
 
 
552 aa  297  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.88 
 
 
640 aa  296  6e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.57 
 
 
674 aa  295  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.41 
 
 
638 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.6 
 
 
640 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  37.09 
 
 
541 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 
572 aa  290  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.57 
 
 
638 aa  289  8e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.56 
 
 
541 aa  289  8e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.67 
 
 
541 aa  289  9e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.26 
 
 
638 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.38 
 
 
636 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.26 
 
 
638 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.61 
 
 
638 aa  286  6e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  38.2 
 
 
541 aa  286  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.88 
 
 
542 aa  285  1e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.74 
 
 
637 aa  285  2e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.19 
 
 
646 aa  285  2e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  44.01 
 
 
712 aa  284  3e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  45 
 
 
629 aa  283  7e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.12 
 
 
541 aa  282  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000751538  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  46.33 
 
 
642 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  46.18 
 
 
633 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.21 
 
 
550 aa  281  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  1.4913e-05 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  43.08 
 
 
713 aa  280  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  37.59 
 
 
546 aa  279  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  44.91 
 
 
672 aa  278  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  47.34 
 
 
681 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.36 
 
 
541 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  43.23 
 
 
712 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  46.05 
 
 
642 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.29 
 
 
716 aa  277  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  34.83 
 
 
541 aa  277  4e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  5.66108e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  34.48 
 
 
541 aa  276  7e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.37 
 
 
639 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  34.97 
 
 
541 aa  275  1e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2511  methyl-accepting chemotaxis protein  45.43 
 
 
653 aa  275  1e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  35.85 
 
 
541 aa  275  1e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.95 
 
 
619 aa  275  2e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2822  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.27 
 
 
673 aa  274  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46 
 
 
541 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45 
 
 
541 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45 
 
 
541 aa  274  4e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  3.42214e-05 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  46.47 
 
 
676 aa  273  5e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.28 
 
 
674 aa  273  9e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1150  chemotaxis sensory transducer  41.05 
 
 
551 aa  272  9e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46 
 
 
541 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.7 
 
 
624 aa  272  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  51.51 
 
 
647 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.76 
 
 
552 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.88 
 
 
564 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3173  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.72 
 
 
541 aa  270  3e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0131988  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45 
 
 
640 aa  270  6e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1015  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.46 
 
 
541 aa  269  8e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.34326e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  42.51 
 
 
640 aa  269  9e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.03 
 
 
653 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.5 
 
 
653 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.77 
 
 
650 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  38.34 
 
 
546 aa  269  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  36.73 
 
 
541 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.3 
 
 
541 aa  268  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.91 
 
 
541 aa  268  3e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00762848  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.43 
 
 
546 aa  266  6e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.43 
 
 
541 aa  266  6e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  42.38 
 
 
647 aa  266  6e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.67 
 
 
541 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.43 
 
 
541 aa  266  8e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0175031  normal  0.083895 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.13 
 
 
541 aa  266  9e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00226615  normal  0.196783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.13 
 
 
541 aa  266  9e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.14454e-05  normal  0.805143 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1117  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.1 
 
 
541 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0100073  normal  0.0339889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  36.73 
 
 
541 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  53.38 
 
 
523 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.19 
 
 
541 aa  263  5e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
638 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.39 
 
 
539 aa  262  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.74 
 
 
674 aa  262  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.78 
 
 
425 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1334  methyl-accepting chemotaxis protein  34.36 
 
 
550 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.43 
 
 
568 aa  261  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2891  chemotaxis sensory transducer  42.39 
 
 
673 aa  260  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  35.71 
 
 
541 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  44.28 
 
 
639 aa  259  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.31 
 
 
544 aa  259  9e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.49 
 
 
438 aa  259  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.07 
 
 
773 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>