More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1673 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
294 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1498  alpha/beta hydrolase fold  41.64 
 
 
324 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  37.82 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  26.22 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  41.82 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  35.94 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  37.93 
 
 
229 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54655  predicted protein  23.08 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  42.42 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  38.06 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.33 
 
 
262 aa  63.5  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
292 aa  63.2  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 
305 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  22.14 
 
 
253 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  37.93 
 
 
274 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  35.65 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0886  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
250 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0910  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
253 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
260 aa  60.5  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  27.72 
 
 
259 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 
302 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 
302 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0803  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
353 aa  59.7  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2886  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
290 aa  59.3  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4035  alpha/beta hydrolase fold protein  23.22 
 
 
280 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.688921  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.34 
 
 
285 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
295 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  22.75 
 
 
311 aa  59.3  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3993  alpha/beta hydrolase fold protein  23.22 
 
 
280 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  33.9 
 
 
275 aa  59.3  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  32.98 
 
 
275 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  27.51 
 
 
259 aa  58.9  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
302 aa  58.9  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  37.27 
 
 
265 aa  58.9  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 
256 aa  58.9  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  28.87 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  28.87 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  38.46 
 
 
261 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  28.87 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  28.87 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  31.3 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  37.24 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  28.17 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  22.85 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
324 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  35.83 
 
 
397 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  29.6 
 
 
265 aa  57.4  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 
314 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  29.75 
 
 
571 aa  57.4  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  38.54 
 
 
295 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  29.57 
 
 
258 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  33.07 
 
 
341 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  33.63 
 
 
309 aa  57.4  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4812  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
317 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744056  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  36.46 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4898  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 
317 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451029  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 
294 aa  57  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5199  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
317 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  hitchhiker  0.000578485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 
267 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 
260 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  30.99 
 
 
334 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.17 
 
 
300 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
254 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  30.43 
 
 
255 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  30.43 
 
 
255 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00325  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02390)  22.96 
 
 
295 aa  55.8  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  28.17 
 
 
300 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1454  alpha/beta hydrolase fold protein  36.75 
 
 
283 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  23.66 
 
 
282 aa  55.8  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 
350 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  24.03 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  35.21 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
340 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
290 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
303 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  24.82 
 
 
260 aa  55.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
271 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 
254 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 
272 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  33.82 
 
 
325 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
340 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  30.12 
 
 
456 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>