15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1598 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1598  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  394  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0101  hypothetical protein  48.42 
 
 
190 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3755  hypothetical protein  50.62 
 
 
195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3804  hypothetical protein  50.62 
 
 
195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.81964  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1520  hypothetical protein  42.78 
 
 
193 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2802  hypothetical protein  43.33 
 
 
196 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.137186 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0809  hypothetical protein  45.03 
 
 
198 aa  141  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2569  hypothetical protein  38.12 
 
 
196 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3537  hypothetical protein  38.12 
 
 
196 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.993733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0796  hypothetical protein  38.58 
 
 
197 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0824  hypothetical protein  38.58 
 
 
197 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2644  hypothetical protein  28.66 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2305  hypothetical protein  26.22 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3679  hypothetical protein  28.47 
 
 
185 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.744055  hitchhiker  0.00232775 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0022  hypothetical protein  25.43 
 
 
179 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>