More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1573 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  100 
 
 
265 aa  538  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  44.66 
 
 
270 aa  217  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  40.54 
 
 
269 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  45.34 
 
 
268 aa  199  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  43.35 
 
 
276 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  43.6 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  42.57 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  40.38 
 
 
269 aa  193  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  41.9 
 
 
274 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  43.5 
 
 
262 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  43.13 
 
 
268 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  43.5 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  44.23 
 
 
290 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  40.08 
 
 
281 aa  187  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  44.96 
 
 
276 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  38.08 
 
 
269 aa  185  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  40.61 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  41 
 
 
263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  38.85 
 
 
270 aa  181  9.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  42.8 
 
 
278 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  39.38 
 
 
270 aa  178  8e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  42.8 
 
 
278 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  43.24 
 
 
278 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  42.91 
 
 
278 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  43.24 
 
 
281 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  43.24 
 
 
281 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  37.69 
 
 
268 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  39.38 
 
 
269 aa  175  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  38.55 
 
 
269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  41.92 
 
 
279 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  42.47 
 
 
278 aa  171  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  38.87 
 
 
270 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  38.87 
 
 
270 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  41.92 
 
 
279 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  38.64 
 
 
269 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  42.86 
 
 
265 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  42.86 
 
 
265 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  34.98 
 
 
263 aa  167  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  32.95 
 
 
261 aa  163  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  33.33 
 
 
260 aa  157  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  35.41 
 
 
270 aa  158  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  34.36 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  37.34 
 
 
267 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  38.8 
 
 
263 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  40.7 
 
 
282 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  31.94 
 
 
263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  36.33 
 
 
260 aa  151  8e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  40.38 
 
 
282 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  40.38 
 
 
282 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  40.38 
 
 
282 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  40.38 
 
 
282 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  40.38 
 
 
282 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  40.38 
 
 
262 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  34.69 
 
 
270 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  37.6 
 
 
263 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  40 
 
 
282 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  36.18 
 
 
263 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  33.58 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  35.25 
 
 
263 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  29.81 
 
 
261 aa  137  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  34.6 
 
 
267 aa  136  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  33.2 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  36.8 
 
 
263 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  38.02 
 
 
254 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  35.6 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  31.8 
 
 
258 aa  125  9e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  34.16 
 
 
254 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0824  transcriptional regulator, ModE family  31.75 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.027921  hitchhiker  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0799  ModE family transcriptional regulator  31.62 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  33.2 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3537  ModE family transcriptional regulator  31.35 
 
 
259 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000170049  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3194  ModE family transcriptional regulator  31.7 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.112161  hitchhiker  0.0000253797 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0831  ModE family transcriptional regulator  31.62 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000109741  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0744  ModE family transcriptional regulator  33.02 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0139669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  32.79 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  32.71 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3862  molybdenum transport regulatory protein ModE  33.95 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  36.07 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0770  ModE family transcriptional regulator  31.7 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  35.92 
 
 
254 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2640  ModE family transcriptional regulator  29.73 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0622782  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  35.25 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  41.43 
 
 
142 aa  108  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  32.93 
 
 
263 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  37.07 
 
 
254 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  32.7 
 
 
262 aa  105  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  33.61 
 
 
254 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5178  ModE family transcriptional regulator  34.72 
 
 
254 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047301  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2857  molybdenum-pterin binding protein  43.06 
 
 
155 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.951599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  43.1 
 
 
114 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  29.64 
 
 
263 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0784  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.08 
 
 
262 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  30.08 
 
 
263 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2939  DNA-binding transcriptional regulator ModE  32.02 
 
 
263 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1416  DNA-binding transcriptional regulator ModE  32.02 
 
 
298 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  40 
 
 
141 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  37.32 
 
 
142 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  30 
 
 
263 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  43.14 
 
 
126 aa  99.8  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2852  DNA-binding transcriptional regulator ModE  31.62 
 
 
263 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>