More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1560 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 220 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  69.27 
 
 		 220 aa  300  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  68.04 
 
 		 221 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  68.04 
 
 		 221 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  68.04 
 
 		 221 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  68.04 
 
 		 221 aa  297  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  67.89 
 
 		 220 aa  296  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  68.81 
 
 		 219 aa  295  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  66.06 
 
 		 220 aa  294  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  68.35 
 
 		 219 aa  294  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  68.81 
 
 		 219 aa  294  8e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  66.51 
 
 		 220 aa  291  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 220 aa  285  4e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  62.44 
 
 		 221 aa  275  5e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  64.06 
 
 		 219 aa  272  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  62.56 
 
 		 227 aa  264  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  66.2 
 
 		 221 aa  260  8.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  58.64 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  57.73 
 
 		 220 aa  254  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  60 
 
 		 221 aa  249  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  58.99 
 
 		 218 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  58.99 
 
 		 218 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  58.53 
 
 		 217 aa  246  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  58.53 
 
 		 218 aa  244  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  61.01 
 
 		 217 aa  244  8e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  58.06 
 
 		 218 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  58.9 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  57.6 
 
 		 218 aa  240  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  57.6 
 
 		 218 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  57.34 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  57.6 
 
 		 218 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  57.14 
 
 		 218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  57.6 
 
 		 218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  57.27 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  52.31 
 
 		 217 aa  234  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  53.18 
 
 		 220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  53.15 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  50.92 
 
 		 218 aa  232  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  52.78 
 
 		 217 aa  231  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  51.39 
 
 		 217 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  58.38 
 
 		 216 aa  230  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  56.62 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  52.25 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  55.45 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  55.45 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  57.73 
 
 		 200 aa  226  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  56.7 
 
 		 208 aa  224  8e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  61.14 
 
 		 199 aa  219  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  55.09 
 
 		 218 aa  216  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  59.59 
 
 		 201 aa  215  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  49.35 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2384  riboflavin synthase subunit alpha  53.09 
 
 		 200 aa  211  7.999999999999999e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.599759  normal  0.02171 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  55.84 
 
 		 200 aa  208  5e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  55.84 
 
 		 200 aa  208  6e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  56.57 
 
 		 197 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  49.32 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  53.37 
 
 		 209 aa  201  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  53.37 
 
 		 196 aa  201  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  53.24 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 217 aa  197  9e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  53.57 
 
 		 208 aa  194  7e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  49.77 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  46.61 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  52.34 
 
 		 210 aa  191  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  47.98 
 
 		 223 aa  191  9e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  47.32 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  43.98 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  43.58 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  52.48 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  52.48 
 
 		 209 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0894  riboflavin synthase subunit alpha  51.94 
 
 		 204 aa  188  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3100  riboflavin synthase subunit alpha  50.97 
 
 		 204 aa  188  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  52.06 
 
 		 202 aa  187  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  51.79 
 
 		 197 aa  188  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0921  riboflavin synthase subunit alpha  52.48 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  52 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  47.98 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0480  riboflavin synthase subunit alpha  52.48 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0959  riboflavin synthase subunit alpha  52.48 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0620  riboflavin synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 204 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  47.25 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  52.48 
 
 		 209 aa  185  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  46.22 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1541  riboflavin synthase subunit alpha  51.49 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4063  riboflavin synthase subunit alpha  50.49 
 
 		 211 aa  184  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  51.55 
 
 		 196 aa  184  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  44.7 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  41.94 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  42.34 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  45.95 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  48.39 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  51.53 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  51.02 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  46.54 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 214 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2014  riboflavin synthase subunit alpha  50.49 
 
 		 204 aa  181  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3013  riboflavin synthase subunit alpha  50.49 
 
 		 204 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>