More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1495 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  100 
 
 		 267 aa  532  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  66.26 
 
 		 259 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  64.11 
 
 		 265 aa  322  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  61 
 
 		 258 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0467  ABC transporter related  59.59 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3016  ABC transporter related  60.73 
 
 		 249 aa  259  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  52.19 
 
 		 258 aa  258  8e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  54.44 
 
 		 264 aa  257  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  52.7 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  47.13 
 
 		 254 aa  237  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  51.64 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  47.13 
 
 		 254 aa  233  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  50.21 
 
 		 302 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  51.65 
 
 		 252 aa  231  8.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  49.79 
 
 		 257 aa  230  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  48.44 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  48.57 
 
 		 265 aa  228  8e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1016  ABC transporter-related protein  48.58 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  50.88 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  48.58 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  51.87 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  45.27 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  46.69 
 
 		 262 aa  211  9e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3497  ABC transporter related  50.21 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  46.56 
 
 		 293 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.18 
 
 		 264 aa  208  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  46.04 
 
 		 295 aa  206  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  47.11 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  45.71 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4716  ABC transporter related  45.64 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592299  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  48.58 
 
 		 277 aa  201  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  43.9 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4114  ABC transporter related  42.64 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0512527  normal  0.918883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  43.82 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  43.82 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0179  ABC transporter related  43.93 
 
 		 244 aa  194  9e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  43.08 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1374  ABC transporter related  43.09 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1453  ABC transporter related  42.51 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5086  ABC transporter related  46.3 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0940761 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1354  ABC transporter related  43.5 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  44.05 
 
 		 275 aa  192  6e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1922  ABC transporter related  44.81 
 
 		 259 aa  191  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  42.57 
 
 		 255 aa  191  9e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  43.2 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  41.26 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  41.3 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  44.49 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1637  ABC transporter related  41.9 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1316  ABC transporter related  41.57 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0818  ABC transporter related  43.9 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232927  normal  0.356957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5556  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 264 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50977 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  40.5 
 
 		 249 aa  189  5.999999999999999e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  42.45 
 
 		 256 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  41.77 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  43.24 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  45.27 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  46.22 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 		 276 aa  186  4e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  48.31 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  43.67 
 
 		 273 aa  185  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  38.8 
 
 		 260 aa  186  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  43.67 
 
 		 273 aa  185  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0892  ABC transporter related  42.86 
 
 		 278 aa  185  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.752922  normal  0.504506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  41.15 
 
 		 262 aa  185  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0852  ABC transporter related  42.86 
 
 		 278 aa  185  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705089  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  42.98 
 
 		 300 aa  185  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  45.04 
 
 		 273 aa  185  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  43.27 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0141  ABC transporter ATP-binding protein  47.88 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0633689  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0159  ABC transporter related  47.88 
 
 		 263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0372  ABC transporter related  44.86 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0038  ABC transporter-like  44.14 
 
 		 267 aa  182  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4484  ABC transporter related  41.13 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04770  ABC transporter, ATP binding component  45.42 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  44.53 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  42.86 
 
 		 273 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 273 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  42.86 
 
 		 273 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  42.86 
 
 		 273 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  41.74 
 
 		 248 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1953  ABC transporter related  40.39 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0810571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1190  ATP-binding ABC transporter protein  39.76 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  41.32 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  44.21 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  42.17 
 
 		 273 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4042  ABC transporter related  42.74 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  40.83 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  39.29 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  41.87 
 
 		 363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0176  ABC transporter related  40 
 
 		 292 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  40.83 
 
 		 333 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0314  ABC transporter ATP-binding protein  40.41 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  43.04 
 
 		 260 aa  179  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  40 
 
 		 361 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  44.3 
 
 		 272 aa  178  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>