More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1494 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  100 
 
 
375 aa  740    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  58.45 
 
 
382 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  54.4 
 
 
386 aa  348  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  42.78 
 
 
393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  40.05 
 
 
380 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  40.79 
 
 
376 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  39.33 
 
 
372 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  36.01 
 
 
383 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  35.1 
 
 
413 aa  211  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  34.44 
 
 
377 aa  209  9e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  34.44 
 
 
377 aa  209  9e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  39.72 
 
 
362 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  34.74 
 
 
377 aa  206  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  48.55 
 
 
384 aa  206  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0799  protein of unknown function DUF140  53.85 
 
 
216 aa  204  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.745929 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  36.59 
 
 
365 aa  202  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0670  hypothetical protein  35.35 
 
 
369 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  43.7 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  37.06 
 
 
368 aa  200  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  30.66 
 
 
370 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  35.15 
 
 
370 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  36.19 
 
 
366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2637  hypothetical protein  37.09 
 
 
401 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  36.19 
 
 
364 aa  195  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  35.9 
 
 
384 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  39.93 
 
 
370 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  38.53 
 
 
382 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  31.07 
 
 
369 aa  192  8e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  31.07 
 
 
369 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  31.79 
 
 
376 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  34.55 
 
 
373 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  30.62 
 
 
369 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  35.68 
 
 
366 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  34.32 
 
 
396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  35.41 
 
 
366 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3136  hypothetical protein  46.86 
 
 
386 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  34.02 
 
 
372 aa  189  9e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  33.13 
 
 
368 aa  188  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  30.75 
 
 
374 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  28.95 
 
 
374 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  34.71 
 
 
367 aa  186  6e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  35.24 
 
 
371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  35.35 
 
 
382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  35.6 
 
 
377 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  35.6 
 
 
377 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1058  protein of unknown function DUF140  38.24 
 
 
375 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00141261  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  35.25 
 
 
377 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  34.98 
 
 
373 aa  181  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1985  ABC transporter permease protein  37.2 
 
 
373 aa  180  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  34.99 
 
 
377 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  32.01 
 
 
368 aa  179  9e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  33.84 
 
 
344 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  35.64 
 
 
379 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  36.55 
 
 
379 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  35.31 
 
 
383 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  39.42 
 
 
382 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  35.23 
 
 
384 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  34.55 
 
 
376 aa  176  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  32.89 
 
 
375 aa  176  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  40.35 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  42.97 
 
 
370 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  40.35 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  33.77 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0038  protein of unknown function DUF140  39.01 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  36.33 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  32.84 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  37.79 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  37.75 
 
 
430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  33.82 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  34.51 
 
 
378 aa  173  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  34.82 
 
 
385 aa  173  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  35.96 
 
 
381 aa  173  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  38.27 
 
 
406 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  35.14 
 
 
364 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  33.63 
 
 
383 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  35.17 
 
 
376 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  40.59 
 
 
378 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  31.91 
 
 
374 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  36.76 
 
 
447 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  34.4 
 
 
394 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  34.02 
 
 
374 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  43.44 
 
 
266 aa  169  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  35.52 
 
 
383 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  34.41 
 
 
378 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  34.02 
 
 
382 aa  169  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  38.4 
 
 
368 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  34.72 
 
 
388 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  39.13 
 
 
374 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  34.02 
 
 
381 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  33.24 
 
 
377 aa  166  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  37.86 
 
 
376 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  32.14 
 
 
383 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  33.53 
 
 
384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  35.01 
 
 
474 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  43.5 
 
 
257 aa  166  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  32.17 
 
 
383 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  36.43 
 
 
374 aa  166  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  33.43 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1017  hypothetical protein  33.15 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  34.56 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>