25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1408 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1408  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 181 aa  338  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153837  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2556  hypothetical protein  54.46 
 
 		 137 aa  90.5  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000429913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1155  TPR repeat-containing protein  55.67 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4546  hypothetical protein  41.21 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.154119  hitchhiker  0.00000513157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4682  hypothetical protein  43.41 
 
 		 266 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183393 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0649  Tetratricopeptide repeat protein  38.79 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4680  hypothetical protein  50 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239335  hitchhiker  0.0000000000172604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1003  tetratricopeptide TPR_4  50.51 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.927358  hitchhiker  0.000000000000175577 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0843  TPR repeat-containing protein  47.83 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62190  hypothetical protein  48 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.417124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5414  hypothetical protein  42.25 
 
 		 262 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0978  hypothetical protein  47.83 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.279934  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0752  hypothetical protein  50 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.443944  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1992  TPR domain-containing protein  47.73 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.885069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4791  putative lipoprotein  44 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0132705  hitchhiker  0.00029593 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1296  TPR repeat-containing protein  38.65 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42550  hypothetical protein  50.6 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0533  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0826  hypothetical protein  41.43 
 
 		 121 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0118814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1469  hypothetical protein  35.51 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1647  hypothetical protein  36.84 
 
 		 290 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.14103  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0680  hypothetical protein  30.34 
 
 		 193 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3094  hypothetical protein  38.95 
 
 		 177 aa  47.8  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.779162 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2162  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  32.99 
 
 		 1265 aa  44.3  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>