More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1370 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.43 
 
 
141 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.07 
 
 
141 aa  143  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.04 
 
 
137 aa  141  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.62 
 
 
140 aa  133  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.55 
 
 
140 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1613  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.65 
 
 
142 aa  130  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.921592  normal  0.194939 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  47.1 
 
 
142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  50.39 
 
 
146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  50.39 
 
 
146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  48.12 
 
 
143 aa  128  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.32 
 
 
142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2554  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.06 
 
 
141 aa  123  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1634  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.52 
 
 
143 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0335583  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.18 
 
 
140 aa  120  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3846  biopolymer transport protein ExbD/TolR family  46.81 
 
 
143 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.661546  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  39.1 
 
 
141 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  45.45 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.84 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.79 
 
 
138 aa  107  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000374903  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.44 
 
 
142 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2091  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.81 
 
 
140 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0833564  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 
145 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  38.28 
 
 
154 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  35.82 
 
 
145 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1555  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.88 
 
 
141 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0536  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.66 
 
 
143 aa  103  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000196939  hitchhiker  0.000000905807 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2304  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.88 
 
 
141 aa  103  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0677093  normal  0.134165 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.55 
 
 
137 aa  103  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.23 
 
 
142 aa  103  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.75 
 
 
142 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0584856  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4892  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.13 
 
 
144 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3571  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.26 
 
 
141 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161015  decreased coverage  0.00354496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.17 
 
 
143 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395657  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2565  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.13 
 
 
141 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  hitchhiker  0.00490818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2948  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.41 
 
 
142 aa  100  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2484  putative biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  39.86 
 
 
147 aa  100  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0200822  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.26 
 
 
141 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1924  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.13 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.76 
 
 
144 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0605408  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1510  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.76 
 
 
144 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43562  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2642  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.69 
 
 
147 aa  97.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3815  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.76 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446813  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0285  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.17 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1899  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.04 
 
 
144 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000511207 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1509  biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  40.3 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.171101  normal  0.278773 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1317  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.59 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.893415  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0313  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.83 
 
 
158 aa  91.3  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.84 
 
 
158 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.78 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  35.34 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.34 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.5 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.92 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4033  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.3 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.06 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3905  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396754  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  32.33 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  34.06 
 
 
133 aa  72  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.88 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  32.79 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.15 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  30.16 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  30.77 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  31.15 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1239  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.03 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.371549  normal  0.35298 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.29 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.2 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0453  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00775346  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  27.82 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.15 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.77 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.61 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  30.08 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2155  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.15 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.89 
 
 
140 aa  67  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.71 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1847  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.83 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.730316  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.29 
 
 
139 aa  67  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2097  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.97 
 
 
164 aa  67  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0862483  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  29.51 
 
 
139 aa  67  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  31.16 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.23 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.55 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.15 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.61 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.203844  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2428  biopolymer transport ExbD like protein  32 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.303812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4176  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0919098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  35 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  0.00000182227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4149  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0136307  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3106  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0993721  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  31.16 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2392  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.81 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.791616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3016  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.88 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.45 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.97 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>