158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1362 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  100 
 
 		 344 aa  693    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  62.28 
 
 		 356 aa  431  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  62.1 
 
 		 344 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  58.43 
 
 		 350 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  56.27 
 
 		 341 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  58.89 
 
 		 351 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  54.68 
 
 		 367 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  57.6 
 
 		 342 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  59.18 
 
 		 342 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  55.13 
 
 		 376 aa  377  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  55.07 
 
 		 341 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  57.89 
 
 		 343 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  55.36 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  55.49 
 
 		 343 aa  368  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  55.49 
 
 		 343 aa  368  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  55.52 
 
 		 341 aa  362  4e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  55.43 
 
 		 386 aa  362  4e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  54.25 
 
 		 357 aa  361  9e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  54.2 
 
 		 340 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  49.12 
 
 		 363 aa  343  2e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  48.68 
 
 		 345 aa  342  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  48.68 
 
 		 345 aa  342  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  49.12 
 
 		 363 aa  342  5e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  48.82 
 
 		 345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  54.39 
 
 		 365 aa  322  4e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  49.54 
 
 		 328 aa  315  6e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  42.4 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  42.9 
 
 		 322 aa  282  5.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  39.77 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  43.07 
 
 		 348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  39.47 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1581  Agmatine deiminase  41.12 
 
 		 330 aa  270  4e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.715324  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  40.71 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  38.6 
 
 		 325 aa  266  5e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  43.66 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  43.39 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  42.15 
 
 		 350 aa  257  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  40.18 
 
 		 349 aa  256  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  38.41 
 
 		 322 aa  257  3e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  43.15 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  42.73 
 
 		 348 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  42.77 
 
 		 334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  43.36 
 
 		 348 aa  252  8.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  41.42 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  40.23 
 
 		 349 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  38.35 
 
 		 339 aa  250  3e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  43.36 
 
 		 348 aa  249  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  38.44 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  41.23 
 
 		 347 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  40.41 
 
 		 352 aa  246  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  41 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  39.77 
 
 		 349 aa  243  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  39.64 
 
 		 639 aa  241  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  37.28 
 
 		 352 aa  239  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  38.55 
 
 		 640 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  36.58 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  37.96 
 
 		 353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  37.61 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  38.55 
 
 		 347 aa  233  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  38.62 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  39.47 
 
 		 624 aa  231  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00673  peptidyl-arginine deiminase  39.53 
 
 		 354 aa  230  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3964  peptidyl-arginine deiminase  36.92 
 
 		 350 aa  226  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  35.59 
 
 		 349 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  35.4 
 
 		 631 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  37.36 
 
 		 365 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  38.1 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  34.9 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  36.23 
 
 		 358 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  34.54 
 
 		 369 aa  208  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  40 
 
 		 332 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1873  GGDEF  33.82 
 
 		 339 aa  204  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0147389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  33.52 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  38.04 
 
 		 383 aa  202  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  34.35 
 
 		 368 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  34.36 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  37.03 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  34.63 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  34.35 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  34.64 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  32.14 
 
 		 355 aa  197  3e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  33.52 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2450  agmatine deiminase  33.82 
 
 		 393 aa  193  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  33.15 
 
 		 367 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  33.62 
 
 		 367 aa  193  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  32.12 
 
 		 365 aa  192  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  32.12 
 
 		 371 aa  192  9e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  32.12 
 
 		 371 aa  192  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  38.19 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  33.89 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  33.15 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  36.63 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  34.08 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  30.56 
 
 		 366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1751  agmatine deiminase  34.78 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  32.03 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  31.42 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  31.56 
 
 		 364 aa  187  3e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  32.51 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3209  agmatine deiminase  35.36 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>