33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1315 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1315  prevent-host-death family protein  100 
 
 
78 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147155  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3050  prevent-host-death family protein  45 
 
 
80 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  42.5 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  42.5 
 
 
80 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1318  prevent-host-death family protein  42.5 
 
 
80 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.404403  normal  0.571647 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1782  prevent-host-death family protein  41.03 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  38.55 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3886  prevent-host-death family protein  39.76 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0775  prevent-host-death protein  50 
 
 
79 aa  48.9  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1597  prevent-host-death family protein  49.09 
 
 
73 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2596  prevent-host-death family protein  35.62 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2983  prevent-host-death family protein  35.62 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.413921  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  43.1 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1901  prevent-host-death family protein  37.31 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00389172  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  45.83 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5801  prevent-host-death family protein  36.9 
 
 
82 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.866899  normal  0.0690534 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0108  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 
71 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0788  prevent-host-death family protein  47.83 
 
 
95 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424176  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  47.73 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1066  prevent-host-death family protein  51.16 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4019  prevent-host-death family protein  45.28 
 
 
82 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0895  prevent-host-death protein  40.91 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6345  prevent-host-death protein  43.48 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000824395  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0061  prevent-host-death family protein  48.84 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933415  normal  0.536193 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2347  antitoxin of a toxin/antitoxin system, phd-like protein  42.5 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0206  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
76 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581637  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3631  prevent-host-death family protein  46.51 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0575  prevent-host-death protein  52.94 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103149  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  47.5 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2456  prevent-host-death family protein  48.72 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2469  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117875  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3369  prevent-host-death family protein  41.3 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0934085  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>