More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1235 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  45.66 
 
 		 207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3800  electron transport protein SCO1/SenC  40.34 
 
 		 219 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3873  electron transport protein SCO1/SenC  40.34 
 
 		 219 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3999  electron transport protein SCO1/SenC  39.91 
 
 		 219 aa  159  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4615  SCO1/SenC family protein  42.06 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4121  electron transport protein SCO1/SenC  39.91 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4320  electron transport protein SCO1/SenC  39.91 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4189  electron transport protein SCO1/SenC  39.91 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0146  electron transport protein SCO1/SenC  39.91 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1191  SCO1/SenC family protein  38.05 
 
 		 220 aa  148  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0364424  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04004  uncharacterized secreted protein of SCO1/SenC/PrrC family  49.65 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0109  electron transport protein SCO1/SenC  42.53 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  37 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0480  hypothetical protein  35.33 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  40.37 
 
 		 224 aa  138  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0456  hypothetical protein  35.33 
 
 		 213 aa  138  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0189  electron transport protein SCO1/SenC  37.21 
 
 		 218 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3790  electron transport protein SCO1/SenC  39.68 
 
 		 210 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  34.85 
 
 		 203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0116  electron transport protein SCO1/SenC  45.71 
 
 		 211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5259  Sco1/SenC family protein  35.07 
 
 		 210 aa  134  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3525  electron transport protein SCO1/SenC  36.07 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4237  electron transport protein SCO1/SenC  43.97 
 
 		 212 aa  133  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  38.02 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  38.38 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0249  electron transport protein SCO1/SenC  33.49 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0169  electron transport protein SCO1/SenC  34.72 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  34.76 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  39.88 
 
 		 211 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0228  SCO1/SenC family protein  35.33 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0045  GGDEF  30.09 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.986314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  33.18 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  33.65 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  33.96 
 
 		 210 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0284  electron transport protein SCO1/SenC  34.3 
 
 		 210 aa  121  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  33.96 
 
 		 210 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  38.73 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01258  SCO1/SenC superfamily  33.14 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0151  electron transport protein SCO1/SenC  35.64 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  38.1 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  35.2 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0823  electron transport protein SCO1/SenC  32.87 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108097  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  34.74 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1973  electron transport protein SCO1/SenC  34.22 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00159059  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  32.9 
 
 		 287 aa  115  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  37.2 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  30.95 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2858  electron transport protein SCO1/SenC  32 
 
 		 216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  31.94 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  34.36 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  39.44 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  29.87 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  34.27 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  35.26 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  35.15 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  35.15 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  35.26 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  34.39 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  34.67 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  36.96 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2499  electron transport protein SCO1/SenC  36.69 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  36.48 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  36.94 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  32.9 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  31.19 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  34.97 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  29.94 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  34.43 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3429  electron transport protein SCO1/SenC  32.95 
 
 		 201 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  30.93 
 
 		 200 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  33.33 
 
 		 197 aa  101  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  32.48 
 
 		 196 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  35.71 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  30.99 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  34.36 
 
 		 198 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  32.48 
 
 		 196 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  29.56 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  33.96 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  33.15 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0915  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.836521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  31.48 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  31.85 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  35.76 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  35.22 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  34.15 
 
 		 201 aa  99.4  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2780  electron transport protein SCO1/SenC  37.4 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.668811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  35.44 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  31.9 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  36.96 
 
 		 205 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7280  Electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 		 166 aa  99  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  36.18 
 
 		 209 aa  99  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  32.51 
 
 		 199 aa  99  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  34.75 
 
 		 215 aa  98.6  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  35.14 
 
 		 207 aa  98.6  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>