216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1224 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  100 
 
 		 380 aa  755    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  77.46 
 
 		 401 aa  527  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  68.49 
 
 		 369 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4293  flagellar basal body P-ring protein  72.05 
 
 		 369 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50410  flagellar basal body P-ring protein  72.05 
 
 		 369 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  68.49 
 
 		 369 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  68.22 
 
 		 369 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  68.22 
 
 		 371 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  70.32 
 
 		 362 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  68.02 
 
 		 386 aa  495  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  67.12 
 
 		 369 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  69.45 
 
 		 369 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  68.79 
 
 		 367 aa  481  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1899  flagellar basal body P-ring protein  64.66 
 
 		 376 aa  481  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.046577 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0900  flagellar basal body P-ring protein  67.92 
 
 		 376 aa  484  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06161  flagellar basal body P-ring protein  68.13 
 
 		 372 aa  478  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0591048  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01005  flagellar basal body P-ring protein  68.13 
 
 		 372 aa  478  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  62.89 
 
 		 379 aa  451  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  62.5 
 
 		 365 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  60.43 
 
 		 372 aa  433  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2311  flagellar basal body P-ring protein  61.02 
 
 		 363 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  63.4 
 
 		 366 aa  425  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1310  flagellar basal body P-ring protein  58.24 
 
 		 366 aa  425  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  58.74 
 
 		 363 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01294  flagellar basal body P-ring protein  59.34 
 
 		 363 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  57.88 
 
 		 364 aa  421  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  60.4 
 
 		 363 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  59.34 
 
 		 363 aa  423  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02921  flagellar basal body P-ring protein  59.22 
 
 		 370 aa  424  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1484  flagellar basal body P-ring protein  57.77 
 
 		 363 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.313129  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  57.07 
 
 		 363 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  57.07 
 
 		 363 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  58.04 
 
 		 363 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1168  flagellar basal body P-ring protein  56.99 
 
 		 368 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0244391  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  57.07 
 
 		 363 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  58.15 
 
 		 363 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  57.07 
 
 		 363 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  58.47 
 
 		 363 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  57.77 
 
 		 363 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  60.58 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  56.38 
 
 		 373 aa  411  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3093  flagellar basal body P-ring protein  57.03 
 
 		 370 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3576  flagellar P-ring protein  59.17 
 
 		 362 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3080  flagellar basal body P-ring protein  58.67 
 
 		 363 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1665  flagellar basal body P-ring protein  56.68 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.231572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2917  flagellar basal body P-ring protein  58.82 
 
 		 374 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476897  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2727  flagellar basal body P-ring protein  55.91 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228637 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04916  flagellar basal body P-ring protein  53.35 
 
 		 378 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0513  flagellar basal body P-ring protein  55.97 
 
 		 371 aa  385  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164737  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1712  flagellar basal body P-ring protein  56.9 
 
 		 371 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405686  normal  0.248733 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1231  flagellar basal body P-ring protein  54.52 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0076  flagellar basal body P-ring protein  56.34 
 
 		 371 aa  381  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.322423  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1328  flagellar basal body P-ring protein  54.35 
 
 		 377 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1231  flagellar basal body P-ring protein  54.26 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2914  flagellar basal body P-ring protein  53.13 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.193418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000733  flagellar P-ring protein FlgI  52.72 
 
 		 370 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  54.2 
 
 		 369 aa  368  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0213  flagellar basal body P-ring protein  52.92 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.613431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1630  flagellar basal body P-ring protein  55.19 
 
 		 365 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.891214  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5632  flagellar basal body P-ring protein  53.72 
 
 		 392 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.347995  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0220  flagellar basal body P-ring protein  52.34 
 
 		 391 aa  362  5.0000000000000005e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0646  flagellar basal body P-ring protein  52.03 
 
 		 372 aa  362  6e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2928  flagellar basal body P-ring protein  51.65 
 
 		 394 aa  358  7e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3063  flagellar basal body P-ring protein  51.65 
 
 		 392 aa  358  9e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  49.61 
 
 		 391 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  49.61 
 
 		 391 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  49.61 
 
 		 391 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  49.61 
 
 		 390 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0349  flagellar basal body P-ring protein  52.31 
 
 		 369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3644  flagellar basal body P-ring protein  56.18 
 
 		 371 aa  354  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.185096  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0247  flagellar basal body P-ring protein  51.26 
 
 		 401 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  51.54 
 
 		 397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  51.54 
 
 		 401 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  51.54 
 
 		 400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  51.54 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  51.54 
 
 		 400 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3066  flagellar basal body P-ring protein  54.3 
 
 		 384 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.405902  normal  0.219474 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  50 
 
 		 392 aa  352  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3964  flagellar basal body P-ring protein  51.48 
 
 		 370 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0285  flagellar basal body P-ring protein  51.26 
 
 		 401 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.394102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0469  flagellar basal body P-ring protein  51.26 
 
 		 397 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0062  flagellar basal body P-ring protein  52.02 
 
 		 375 aa  349  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24070  flagellar basal body P-ring protein  54.24 
 
 		 385 aa  349  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3461  flagellar basal body P-ring protein  52.89 
 
 		 372 aa  349  4e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4678  flagellar P-ring protein  51.63 
 
 		 374 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218644 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1264  flagellar basal body P-ring protein  49.42 
 
 		 367 aa  348  6e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.236282  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004166  flagellar P-ring protein FlgI  61.87 
 
 		 278 aa  348  7e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3741  flagellar basal body P-ring protein  52.89 
 
 		 394 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.713349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4192  flagellar P-ring protein  52.49 
 
 		 377 aa  346  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3571  flagellar basal body P-ring protein  48.66 
 
 		 368 aa  343  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0068  flagellar basal body P-ring protein  53.18 
 
 		 376 aa  343  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2963  flagellar basal body P-ring protein  50.4 
 
 		 366 aa  342  8e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.863915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0626  flagellar basal body P-ring protein  48.56 
 
 		 382 aa  342  8e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4428  flagellar basal body P-ring protein  52.59 
 
 		 388 aa  342  8e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4784  flagellar basal body P-ring protein  51.14 
 
 		 372 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.341084 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3707  flagellar basal body P-ring protein  51.14 
 
 		 372 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0982974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0562  flagellar basal body P-ring protein  51.56 
 
 		 385 aa  340  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1961  flagellar basal body P-ring protein  51.45 
 
 		 368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3721  flagellar basal body P-ring protein  49.19 
 
 		 381 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143633  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3835  flagellar basal body P-ring protein  52.31 
 
 		 374 aa  332  5e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>