68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1056 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1056  protein of unknown function DUF107  100 
 
 		 153 aa  300  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  33.08 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  32.33 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  28.28 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  29.66 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  26.21 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  30.5 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  30.5 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  30.5 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  30.34 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  30.71 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  28.97 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  28.97 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  42.03 
 
 		 455 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  28.97 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  28.28 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  28.28 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1783  hypothetical protein  31.43 
 
 		 490 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  30.43 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  28.28 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  29.08 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  27.89 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0200  hypothetical protein  29.73 
 
 		 448 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  29.55 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0221  hypothetical protein  29.73 
 
 		 448 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  30.99 
 
 		 489 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  28.75 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  28.75 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  32.59 
 
 		 510 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  31.16 
 
 		 496 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  27.4 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  34.68 
 
 		 437 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  27.89 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  27.59 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0052  protein of unknown function DUF107  32.45 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  28.28 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0805  hypothetical protein  33.1 
 
 		 491 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.743385  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0224  hypothetical protein  30.56 
 
 		 447 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0268  hypothetical protein  28.57 
 
 		 449 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  32.64 
 
 		 463 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  32.11 
 
 		 458 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5124  hypothetical protein  29.33 
 
 		 508 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417825 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1879  hypothetical protein  35.04 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0165803  normal  0.0358717 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4390  protein of unknown function DUF107  55 
 
 		 467 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  30.5 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  44.3  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  29.63 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5652  protein of unknown function DUF107  31.03 
 
 		 522 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.995494 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  28.12 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  28.28 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1082  hypothetical protein  29.8 
 
 		 546 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409123  hitchhiker  0.00827512 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  30.41 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  25.9 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  23.13 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  25.74 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0824  NfeD family protein  29.75 
 
 		 501 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  28.46 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0916  NfeD family protein  29.75 
 
 		 503 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1227  protein of unknown function DUF107  26.12 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2176  nodulation efficiency protein D  29.75 
 
 		 560 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05730  hypothetical protein  28.48 
 
 		 472 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.962893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  25.19 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  24.49 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  30.66 
 
 		 460 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  25.34 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  45.45 
 
 		 488 aa  40.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1805  nodulation competitiveness protein nfeD  47.37 
 
 		 557 aa  40.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>