74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0853 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0853  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00963426  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0855  hypothetical protein  78.93 
 
 		 280 aa  480  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.102489  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0432  hypothetical protein  64.44 
 
 		 284 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0857  hypothetical protein  48.54 
 
 		 271 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798826  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1594  hypothetical protein  49.36 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0731663  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1670  hypothetical protein  49.15 
 
 		 271 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2281  hypothetical protein  49.15 
 
 		 271 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3780  hypothetical protein  44.73 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3420  hypothetical protein  45.3 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4256  hypothetical protein  43.67 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3252  hypothetical protein  45.3 
 
 		 275 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4961  hypothetical protein  43.23 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379362  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4372  hypothetical protein  42.79 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.692073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3454  hypothetical protein  41.57 
 
 		 273 aa  184  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3130  hypothetical protein  43.86 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3126  hypothetical protein  42.17 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3256  hypothetical protein  40.3 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2434  hypothetical protein  41.35 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2627  hypothetical protein  40.51 
 
 		 271 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1522  hypothetical protein  43.29 
 
 		 276 aa  175  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.56386 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1034  hypothetical protein  37.13 
 
 		 271 aa  161  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal  0.936486 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0805  hypothetical protein  37.5 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2859  hypothetical protein  40.18 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3449  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  38.74 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2863  hypothetical protein  41.8 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3453  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  36.32 
 
 		 259 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3714  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  25.63 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.873772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1906  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  25.63 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.556317  normal  0.0839186 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0514  hypothetical protein  27.87 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000430045  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4153  diheme cytochrome c SoxA  28.44 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0564  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  29.86 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000710636  normal  0.452243 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1154  putative cytochrome c  26.07 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.689886  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0063  putative cytochrome c  28 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7671  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  28.89 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0918  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  26.91 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222213  normal  0.890143 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0263  diheme cytochrome SoxA  26.8 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000154217  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4159  putative sulfur oxidation protein (SoxA); cytochrome c precursor  23.26 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2804  diheme cytochrome c  24.25 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.244051 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3915  secreted protein-like protein  25.1 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.536069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6959  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  26.91 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0143  sulfur oxidation protein  28.75 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1908  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  23.53 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000720789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3674  putative sulfur oxidation protein (SoxA)  22 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1925  sulfur oxidation protein SoxA  29.26 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2761  putative diheme cytochrome C  26.88 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3046  hypothetical protein  25.55 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3673  sulfur oxidation protein  25.98 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0814  sulfur oxidation protein SoxA  26.77 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022188  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0313  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  22.67 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.450378  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0694  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  25 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  34.12 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  24.26 
 
 		 484 aa  54.7  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  33.04 
 
 		 351 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  33.04 
 
 		 352 aa  52.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  30.59 
 
 		 372 aa  52.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  32.14 
 
 		 351 aa  52.4  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  31.09 
 
 		 351 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  30.36 
 
 		 355 aa  49.3  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0601  sulfur oxidation protein SoxA  23.64 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0517322  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  29.41 
 
 		 355 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  30.48 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  28.24 
 
 		 352 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  30.48 
 
 		 309 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  26.89 
 
 		 355 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  30.23 
 
 		 317 aa  46.6  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  26.89 
 
 		 355 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  29.41 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  28.4 
 
 		 350 aa  46.2  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  26.8 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  25 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  30.11 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  25.93 
 
 		 346 aa  42.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  28.74 
 
 		 327 aa  42  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>