More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0799 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  100 
 
 
458 aa  906    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  67.97 
 
 
471 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  53.35 
 
 
448 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  51.08 
 
 
456 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  49.46 
 
 
458 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  48.28 
 
 
449 aa  385  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  50 
 
 
445 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  48.92 
 
 
457 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  48.72 
 
 
458 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  48.08 
 
 
456 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  48.72 
 
 
458 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  48.72 
 
 
458 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  48.72 
 
 
458 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  48.12 
 
 
463 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  49.57 
 
 
454 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  45.14 
 
 
455 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  45.14 
 
 
455 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  45.14 
 
 
455 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  45.14 
 
 
455 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  45.14 
 
 
455 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  45.14 
 
 
455 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  44.92 
 
 
455 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  44.92 
 
 
455 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  44.92 
 
 
455 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  44.92 
 
 
455 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  50 
 
 
455 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  47.23 
 
 
459 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  47.85 
 
 
459 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  47.54 
 
 
457 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  48.82 
 
 
453 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  47.53 
 
 
456 aa  365  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  49.14 
 
 
450 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  46.37 
 
 
462 aa  364  2e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  46.64 
 
 
460 aa  362  9e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  49.12 
 
 
445 aa  361  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  46.59 
 
 
462 aa  361  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  46.26 
 
 
458 aa  360  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  47.65 
 
 
459 aa  360  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  46.24 
 
 
460 aa  359  4e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  46.17 
 
 
448 aa  356  3.9999999999999996e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  45.8 
 
 
460 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  48.61 
 
 
449 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  49.22 
 
 
453 aa  354  1e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  48.49 
 
 
464 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  50.54 
 
 
446 aa  354  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  48.58 
 
 
443 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  43.04 
 
 
441 aa  353  4e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  44.77 
 
 
458 aa  352  1e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  48.67 
 
 
453 aa  351  1e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0403  amino acid carrier protein  47.7 
 
 
493 aa  351  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  45.9 
 
 
458 aa  350  4e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  45.43 
 
 
464 aa  349  5e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  46.52 
 
 
443 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  43.08 
 
 
443 aa  345  1e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  48.76 
 
 
435 aa  345  1e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2725  sodium:alanine symporter  44.42 
 
 
502 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  47.32 
 
 
464 aa  343  5e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  46.04 
 
 
447 aa  342  7e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  46.89 
 
 
467 aa  341  2e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  46.12 
 
 
458 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  48.28 
 
 
459 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00095  putative Na(+)-linked D-alanine glycine permease  44.07 
 
 
542 aa  340  5e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.82713  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  47.43 
 
 
447 aa  339  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  46.46 
 
 
452 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  45.88 
 
 
458 aa  338  8e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  46.46 
 
 
452 aa  338  9e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  45.35 
 
 
452 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  47.68 
 
 
468 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  49.64 
 
 
461 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1871  amino acid carrier protein  43.2 
 
 
524 aa  338  9.999999999999999e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.766139  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2069  amino acid carrier protein  43.64 
 
 
502 aa  336  5e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0217883  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1808  putative sodium:alanine symporter family protein  44.52 
 
 
512 aa  336  5.999999999999999e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.921517  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  45.43 
 
 
464 aa  336  5.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  46.77 
 
 
452 aa  336  7e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  47.88 
 
 
447 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  46.65 
 
 
452 aa  334  2e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1133  amino acid carrier protein  44.64 
 
 
456 aa  333  3e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  46.36 
 
 
459 aa  333  4e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  47.89 
 
 
459 aa  333  5e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  44.89 
 
 
452 aa  332  9e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  44.89 
 
 
452 aa  332  9e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  44.89 
 
 
452 aa  332  9e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  44.89 
 
 
452 aa  332  9e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  49.06 
 
 
424 aa  331  2e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  44.71 
 
 
457 aa  331  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2083  amino acid transport integral membrane protein  42.74 
 
 
553 aa  330  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.842232  normal  0.31431 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1604  amino acid carrier protein  45.71 
 
 
498 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000273653 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  45.08 
 
 
457 aa  327  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0834  Sodium:alanine symporter  46.67 
 
 
456 aa  327  3e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0461  D-alanine glycine permease  46.19 
 
 
458 aa  327  3e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0104177  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4787  amino acid carrier protein  45.21 
 
 
499 aa  327  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  41.99 
 
 
460 aa  326  7e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2159  Na+/alanine symporter  46.15 
 
 
460 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4149  amino acid carrier protein  54.81 
 
 
553 aa  324  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306456  normal  0.0111576 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0495  Na+ linked D-alanine glycine permease component  43.24 
 
 
504 aa  324  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304972  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  47.52 
 
 
452 aa  322  8e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0060  amino acid carrier protein  42.65 
 
 
503 aa  322  8e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.706762 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  44.52 
 
 
456 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2656  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  45.79 
 
 
426 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168097  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  45.49 
 
 
476 aa  320  3.9999999999999996e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>