28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0707 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2313  neutral invertase  69.89 
 
 		 465 aa  671    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0707  neutral invertase  100 
 
 		 474 aa  973    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3299  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0226  neutral invertase  58.72 
 
 		 492 aa  549  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4707  neutral invertase  49.89 
 
 		 482 aa  486  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0609  neutral invertase  49.89 
 
 		 483 aa  482  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00065977  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2774  neutral invertase  47.12 
 
 		 457 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1847  putative neutral invertase-like protein  35.85 
 
 		 485 aa  319  6e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.570169  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0397  putative neutral invertase  40.57 
 
 		 463 aa  317  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0487  putative neutral invertase-like protein  36.31 
 
 		 485 aa  309  5.9999999999999995e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.782741  normal  0.616343 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03531  putative neutral invertase-like protein  36.12 
 
 		 479 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0333  putative neutral invertase-like protein  35.17 
 
 		 479 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03511  putative neutral invertase-like protein  36.12 
 
 		 479 aa  306  6e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.268956  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03631  putative neutral invertase-like protein  35.28 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.072592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1704  putative neutral invertase-like protein  35.44 
 
 		 483 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04191  putative neutral invertase-like protein  35.23 
 
 		 483 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.659248 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03591  putative neutral invertase-like protein  33.81 
 
 		 479 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.628204  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21831  putative neutral invertase-like protein  35.56 
 
 		 488 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1137  hypothetical protein  31.08 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0252196  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2516  glycogen debranching enzyme-like protein  25.74 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01235  hypothetical protein  20.53 
 
 		 389 aa  56.6  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1828  glycogen debranching protein  31.87 
 
 		 458 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  30.54 
 
 		 698 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2424  hypothetical protein  29.68 
 
 		 391 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.481208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1793  hypothetical protein  30.13 
 
 		 391 aa  47.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0265229 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1673  hypothetical protein  23.08 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3891  hypothetical protein  31.36 
 
 		 394 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  33.33 
 
 		 459 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0242  hypothetical protein  32.61 
 
 		 400 aa  43.9  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>