More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0706 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0706  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 356 aa  733    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.578959  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2318  diguanylate phosphodiesterase  51.39 
 
 		 371 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440144  normal  0.199138 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2042  diguanylate phosphodiesterase  46.57 
 
 		 352 aa  331  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0058  diguanylate phosphodiesterase  47.46 
 
 		 357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1073  diguanylate phosphodiesterase  43.98 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0220  hypothetical protein  38.38 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  37.71 
 
 		 734 aa  250  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0220  hypothetical protein  38.66 
 
 		 360 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  36.57 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0635  diguanylate phosphodiesterase  42.23 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1233  diguanylate phosphodiesterase  39.39 
 
 		 258 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1172  diguanylate phosphodiesterase  40.51 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1408  diguanylate phosphodiesterase  41.1 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0264  diguanylate phosphodiesterase  37.45 
 
 		 259 aa  176  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0236  EAL domain protein  38.3 
 
 		 260 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0171  EAL  37.45 
 
 		 260 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3825  hypothetical protein  42.73 
 
 		 249 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2208  diguanylate phosphodiesterase  37.87 
 
 		 254 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0883  diguanylate phosphodiesterase  38.91 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1247  hypothetical protein  38.06 
 
 		 257 aa  169  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000126257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3442  diguanylate phosphodiesterase  40.18 
 
 		 254 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3242  EAL domain-containing protein  39 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2810  diguanylate phosphodiesterase  37.29 
 
 		 257 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3566  diguanylate phosphodiesterase  38.4 
 
 		 265 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333064  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.26 
 
 		 584 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3438  diguanylate phosphodiesterase  38.4 
 
 		 265 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2830  diguanylate phosphodiesterase  40.89 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.011956  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4934  diguanylate phosphodiesterase  36.77 
 
 		 256 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000539515  normal  0.673945 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0525  diguanylate phosphodiesterase  38.94 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0914  EAL domain-containing protein  35.04 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1747  diguanylate phosphodiesterase  39.17 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.087315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1584  diguanylate phosphodiesterase  38.12 
 
 		 263 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0237519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1310  diguanylate phosphodiesterase  37.61 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.016111  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0028  diguanylate phosphodiesterase  38.57 
 
 		 255 aa  160  5e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1598  GGDEF:CBS:EAL  39.29 
 
 		 590 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.29213  normal  0.0431902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2934  diguanylate phosphodiesterase  39.46 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.780718  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  36.05 
 
 		 379 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  39.27 
 
 		 357 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0026  diguanylate phosphodiesterase  37.73 
 
 		 246 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0024  diguanylate phosphodiesterase  37.73 
 
 		 246 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.481277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0806  signal protein  38.46 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  39.29 
 
 		 590 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.82 
 
 		 596 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0637  hypothetical protein  38.98 
 
 		 257 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00815017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3107  diguanylate phosphodiesterase  39.13 
 
 		 259 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.757565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3232  diguanylate phosphodiesterase  35.47 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72536  normal  0.33635 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.22 
 
 		 632 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.12 
 
 		 797 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.29 
 
 		 605 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.29 
 
 		 633 aa  150  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.72 
 
 		 786 aa  150  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000781405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  39.01 
 
 		 582 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.76 
 
 		 773 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0005  diguanylate phosphodiesterase  35.56 
 
 		 259 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.33 
 
 		 766 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  39.65 
 
 		 601 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1510  diguanylate phosphodiesterase  35.87 
 
 		 475 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2103  cyclic-di-GMP regulatory protein  36.44 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3093  cyclic-di-GMP regulatory protein  36.13 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0272737 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.73 
 
 		 590 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.17 
 
 		 572 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.21 
 
 		 753 aa  143  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1965  diguanylate phosphodiesterase  36.52 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.33 
 
 		 581 aa  142  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.83 
 
 		 883 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0545  diguanylate phosphodiesterase  34.84 
 
 		 257 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3571  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.15 
 
 		 611 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  37.89 
 
 		 592 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1902  diguanylate phosphodiesterase  34.68 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.570063 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3798  diguanylate phosphodiesterase  34.43 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0519  diguanylate phosphodiesterase  34.43 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.9 
 
 		 580 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0601  diguanylate phosphodiesterase  32.79 
 
 		 258 aa  139  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0792  diguanylate phosphodiesterase  37.44 
 
 		 224 aa  139  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.307783 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0541  diguanylate phosphodiesterase  33.61 
 
 		 257 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2731  putative diguanylate phosphodiesterase  35.11 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1371  diguanylate phosphodiesterase  31.93 
 
 		 361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 		 599 aa  134  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1388  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.23 
 
 		 806 aa  134  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844108  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2342  diguanylate phosphodiesterase  36.82 
 
 		 257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1138  diguanylate phosphodiesterase  35.91 
 
 		 266 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  33.05 
 
 		 584 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00175  hypothetical protein ycgF  34.62 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1514  diguanylate phosphodiesterase  35.42 
 
 		 437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000323461  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.98 
 
 		 583 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  34.53 
 
 		 584 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.53 
 
 		 583 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.53 
 
 		 584 aa  127  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.53 
 
 		 584 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.53 
 
 		 585 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.53 
 
 		 585 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.53 
 
 		 585 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.53 
 
 		 585 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.28 
 
 		 790 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  35.29 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1754  diguanylate phosphodiesterase  36.75 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2032  diguanylate phosphodiesterase  32.78 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0705  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.2 
 
 		 590 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  31.93 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.37 
 
 		 777 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.36212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>