124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0666 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0666  dienelactone hydrolase  100 
 
 
284 aa  587  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0053  dienelactone hydrolase  58.09 
 
 
290 aa  298  5e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2269  putative dienelactone hydrolase  38.39 
 
 
266 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0914  dienelactone hydrolase  26.75 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177135  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  26.78 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  25.44 
 
 
270 aa  58.9  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  24.59 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 
290 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  24.61 
 
 
290 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  23.75 
 
 
277 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  33.87 
 
 
243 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  27.55 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  23.37 
 
 
290 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  23.37 
 
 
290 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  25 
 
 
326 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  23.37 
 
 
290 aa  53.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  26.03 
 
 
214 aa  53.5  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  27.2 
 
 
287 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  26.58 
 
 
655 aa  52.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  20.7 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  31.5 
 
 
241 aa  52  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  24.44 
 
 
292 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  24.89 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  25.33 
 
 
242 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  25.33 
 
 
242 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  24.9 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  21.4 
 
 
284 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  25.6 
 
 
275 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  24.27 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  24.27 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  24.27 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  24.27 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  24.27 
 
 
271 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  26.13 
 
 
640 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  28.51 
 
 
296 aa  49.3  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  28.36 
 
 
250 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0735  carboxymethylenebutenolidase  24.31 
 
 
296 aa  49.3  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  24.8 
 
 
291 aa  48.9  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  23.43 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  24.46 
 
 
275 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2684  dienelactone hydrolase  29.09 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.12 
 
 
706 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630914  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  23.43 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0608  carboxymethylenebutenolidase  25.3 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  24.27 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  28.28 
 
 
227 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  23.53 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  23.85 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  24.27 
 
 
275 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  23.95 
 
 
275 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.96 
 
 
631 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  24.79 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  24.13 
 
 
294 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  23.85 
 
 
271 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  23.85 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  24.58 
 
 
269 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  24.53 
 
 
291 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  25.87 
 
 
261 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  23.43 
 
 
270 aa  47  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  23.61 
 
 
291 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  23.61 
 
 
291 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  23.61 
 
 
291 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  24.36 
 
 
291 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  23.81 
 
 
291 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  23.08 
 
 
334 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  23.61 
 
 
291 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  24.34 
 
 
335 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  23.61 
 
 
280 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  26.32 
 
 
254 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  24.6 
 
 
264 aa  45.8  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  23.91 
 
 
291 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  25.23 
 
 
295 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  25.23 
 
 
295 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1783  Carboxymethylenebutenolidase  23.73 
 
 
227 aa  45.8  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  23.04 
 
 
281 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  24.32 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  25.93 
 
 
297 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  22.54 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  23.15 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  24.03 
 
 
866 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2091  carboxymethylenebutenolidase  26.86 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3842  Carboxymethylenebutenolidase  24.05 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  23.97 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  25.23 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  23.65 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  22.54 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  25.49 
 
 
546 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3774  hypothetical protein  26.92 
 
 
533 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113955  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  22.54 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  22.54 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  22.54 
 
 
339 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  22.54 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  22.54 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3006  dienelactone hydrolase  32.35 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.146307  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  25.48 
 
 
407 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  21.98 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  25.52 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  25.53 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0594  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.2 
 
 
623 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.33 
 
 
924 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243991 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>