More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0639 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  53.09 
 
 		 195 aa  191  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  49.72 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  47.22 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  48.63 
 
 		 201 aa  157  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  45.95 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  44.02 
 
 		 201 aa  154  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  46.45 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  41.49 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  41.08 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  41.44 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  41.99 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  39.68 
 
 		 188 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  36.9 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  40.43 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  38.62 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.25 
 
 		 191 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  39.15 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.55 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  37.77 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  41.11 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  39.66 
 
 		 196 aa  111  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  36.81 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  37.36 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 		 247 aa  99.8  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0996  Phosphoglycerate mutase  35.45 
 
 		 239 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 239 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 212 aa  95.1  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  34.2 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1008  phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 243 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0974  phosphoglycerate mutase  35.56 
 
 		 243 aa  91.7  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  39.53 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 212 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 214 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2964  phosphoglycerate mutase  33.48 
 
 		 241 aa  88.6  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  37.64 
 
 		 378 aa  86.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  28.34 
 
 		 213 aa  85.5  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 212 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 212 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.16 
 
 		 369 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3281  phosphoglycerate mutase  32.27 
 
 		 240 aa  84.3  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  27.69 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1031  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  28.88 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.22 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  29 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  29 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  31.32 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  30.37 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0839  phosphoglycerate mutase  31.36 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.7 
 
 		 427 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  34.02 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.8 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.64 
 
 		 378 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3183  phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.71 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  31.89 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.2 
 
 		 365 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.2 
 
 		 365 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.2 
 
 		 365 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3134  putative Alpha-ribazole phosphatase (anaerobic pathway of cobalamin biosynthesis, cobC)  36.99 
 
 		 197 aa  74.3  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.7 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  25.64 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  33.88 
 
 		 383 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.98 
 
 		 382 aa  72.4  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.64 
 
 		 356 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  29.8 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  25.64 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.62 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  24.62 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  24.62 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  24.62 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  24.62 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  25.54 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  27.18 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  28.57 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  28.57 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  27.18 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>