More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0615 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  81.69 
 
 		 415 aa  694    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0729  serine hydroxymethyltransferase  84.78 
 
 		 415 aa  733    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0279  serine hydroxymethyltransferase  77.54 
 
 		 414 aa  654    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3100  serine hydroxymethyltransferase  77.4 
 
 		 414 aa  664    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  81.69 
 
 		 415 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2044  serine hydroxymethyltransferase  77.64 
 
 		 414 aa  662    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110649  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  81.69 
 
 		 415 aa  701    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  81.45 
 
 		 431 aa  691    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0603  serine hydroxymethyltransferase  75.18 
 
 		 416 aa  635    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  81.69 
 
 		 415 aa  701    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  85.27 
 
 		 415 aa  746    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2165  serine hydroxymethyltransferase  77.29 
 
 		 414 aa  671    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.675395  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4246  glycine hydroxymethyltransferase  74.64 
 
 		 438 aa  649    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  81.69 
 
 		 415 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  81.69 
 
 		 415 aa  695    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2754  serine hydroxymethyltransferase  79.95 
 
 		 415 aa  680    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  78.31 
 
 		 415 aa  667    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4955  glycine hydroxymethyltransferase  77.05 
 
 		 415 aa  656    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  81.69 
 
 		 415 aa  701    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  77.16 
 
 		 421 aa  662    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  82.41 
 
 		 415 aa  700    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  81.45 
 
 		 415 aa  701    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  81.45 
 
 		 415 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2658  serine hydroxymethyltransferase  75.85 
 
 		 414 aa  664    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0261213  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2874  serine hydroxymethyltransferase  76.66 
 
 		 414 aa  664    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  80.96 
 
 		 415 aa  706    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1660  serine hydroxymethyltransferase  77.64 
 
 		 414 aa  662    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.445565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0615  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 415 aa  857    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  85.27 
 
 		 508 aa  739    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1551  serine hydroxymethyltransferase  76.39 
 
 		 416 aa  651    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2907  serine hydroxymethyltransferase  77.59 
 
 		 414 aa  670    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291862  normal  0.0486853 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  81.93 
 
 		 415 aa  696    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  81.2 
 
 		 415 aa  694    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0722  serine hydroxymethyltransferase  84.78 
 
 		 436 aa  736    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.142236 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  81.69 
 
 		 415 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  81.93 
 
 		 415 aa  695    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3363  serine hydroxymethyltransferase  81.16 
 
 		 415 aa  686    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  81.2 
 
 		 431 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  80.92 
 
 		 415 aa  686    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  78.26 
 
 		 414 aa  677    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2992  serine hydroxymethyltransferase  76.9 
 
 		 414 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  0.346056 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  81.93 
 
 		 415 aa  696    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  84.54 
 
 		 415 aa  737    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  69.95 
 
 		 430 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  69.31 
 
 		 438 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  66.18 
 
 		 416 aa  566  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3262  serine hydroxymethyltransferase  66.27 
 
 		 454 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 430 aa  551  1e-156  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 		 417 aa  548  1e-155  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 417 aa  550  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  62.08 
 
 		 417 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  62.72 
 
 		 417 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  62.72 
 
 		 417 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  62.72 
 
 		 417 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 		 417 aa  537  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  62.22 
 
 		 417 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  62.72 
 
 		 417 aa  537  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 417 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  61.73 
 
 		 417 aa  533  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  61.98 
 
 		 417 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  61.73 
 
 		 417 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  61.73 
 
 		 417 aa  531  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  61.98 
 
 		 417 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  60.67 
 
 		 417 aa  533  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  62.96 
 
 		 417 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 		 417 aa  528  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  63.14 
 
 		 422 aa  529  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  60.67 
 
 		 417 aa  527  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  60.67 
 
 		 417 aa  527  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  61.43 
 
 		 412 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 420 aa  525  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  60.82 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  62.02 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  60.96 
 
 		 414 aa  524  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 417 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  60.96 
 
 		 414 aa  524  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  60.67 
 
 		 417 aa  522  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  61.06 
 
 		 417 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  59.86 
 
 		 417 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  60.67 
 
 		 417 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0445  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000012571 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  58.89 
 
 		 416 aa  518  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 412 aa  518  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1265  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000077829  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1158  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000444868  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  60.91 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  62.41 
 
 		 439 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 414 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  60.99 
 
 		 432 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 		 413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1660  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 418 aa  513  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479076  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  62.41 
 
 		 438 aa  514  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 415 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  60.52 
 
 		 432 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>