More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0604 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0960  N-6 DNA methylase  52.06 
 
 		 670 aa  644    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1016  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  49.78 
 
 		 680 aa  638    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2687  N-6 DNA methylase  64.3 
 
 		 661 aa  855    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.965628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1480  N-6 DNA methylase  66.21 
 
 		 777 aa  677    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1857  N-6 DNA methylase  54.2 
 
 		 611 aa  678    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.618647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1155  N-6 DNA methylase  63.17 
 
 		 659 aa  843    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0604  type I restriction-modification system, M subunit; N-6 adenine-specific DNA methylase  100 
 
 		 655 aa  1355    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1328  N-6 DNA methylase  60.37 
 
 		 806 aa  650    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.909053  normal  0.133174 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2608  N-6 DNA methylase  64.57 
 
 		 683 aa  880    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.648611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0795  N-6 DNA methylase  50.59 
 
 		 673 aa  655    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0075  N-6 DNA methylase  64.23 
 
 		 658 aa  859    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0234  N-6 DNA methylase  64.44 
 
 		 661 aa  855    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0413  N-6 DNA methylase  63.87 
 
 		 661 aa  861    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190573  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1550  N-6 DNA methylase  50.37 
 
 		 673 aa  632  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.677514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3984  N-6 DNA methylase  47.12 
 
 		 676 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3935  N-6 DNA methylase  47.12 
 
 		 676 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4760  type I restriction-modification system DNA methylase  48.34 
 
 		 659 aa  605  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1060  type I restriction-modification  62.13 
 
 		 675 aa  598  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000030221  normal  0.0378969 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0488  N-6 DNA methylase  61.13 
 
 		 580 aa  596  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19026 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1495  N-6 DNA methylase  48.31 
 
 		 661 aa  593  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.304059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3359  N-6 DNA methylase  45.54 
 
 		 709 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.270263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2680  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  46.95 
 
 		 676 aa  579  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.558636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2868  type I restriction-modification system DNA methylase  48.44 
 
 		 675 aa  578  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0465984  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4253  N-6 DNA methylase  45.1 
 
 		 708 aa  578  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0751  N-6 DNA methylase  47.5 
 
 		 686 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.309292 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4454  N-6 DNA methylase  48.14 
 
 		 675 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  47.03 
 
 		 663 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0684916  normal  0.490543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2604  N-6 DNA methylase  43.29 
 
 		 728 aa  558  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.205723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1792  N-6 DNA methylase  42.88 
 
 		 725 aa  554  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0174866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4916  N-6 DNA methylase  53.76 
 
 		 607 aa  527  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.660274 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22800  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  44.3 
 
 		 644 aa  523  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.386245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0192  N-6 DNA methylase  43.24 
 
 		 583 aa  515  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341004 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19060  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  52 
 
 		 586 aa  476  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0947092 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0276  N-6 DNA methylase  50.42 
 
 		 569 aa  473  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4473  N-6 DNA methylase  41.91 
 
 		 677 aa  460  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1025 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0263  N-6 DNA methylase  39.06 
 
 		 589 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0776  type I restriction-modification system, M subunit  39.29 
 
 		 636 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0115537  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1861  type I restriction-modification system specificity subunit  39.75 
 
 		 710 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3442  N-6 DNA methylase  39.45 
 
 		 592 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  0.982345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3570  N-6 DNA methylase  39.41 
 
 		 647 aa  430  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0641  N-6 DNA methylase  47.53 
 
 		 587 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1517  N-6 DNA methylase  37.11 
 
 		 691 aa  411  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140297 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1367  putative DNA methylase HsdM  33.5 
 
 		 793 aa  405  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0657  N-6 DNA methylase  34.99 
 
 		 725 aa  387  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2941  restriction/modification methyltransferase  39.86 
 
 		 783 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2227  N-6 DNA methylase  56.35 
 
 		 371 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2201  N-6 DNA methylase  43.51 
 
 		 778 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0841  hypothetical protein  41.85 
 
 		 608 aa  366  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0027333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6258  N-6 DNA methylase  39.18 
 
 		 787 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1782  N-6 DNA methylase  40.92 
 
 		 829 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2177  N-6 DNA methylase  41.52 
 
 		 793 aa  362  9e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003234  type I restriction-modification system DNA-methyltransferase subunit M  39.77 
 
 		 794 aa  362  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0278  type I restriction-modification system, M subunit  42.66 
 
 		 790 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2269  type I restriction-modification system DNA methylase  41.67 
 
 		 763 aa  350  4e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1222  N-6 DNA methylase  44.16 
 
 		 552 aa  336  7.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  36.43 
 
 		 799 aa  323  6e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2256  N-6 DNA methylase  46.83 
 
 		 316 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0633793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1365  N-6 DNA methylase  32.44 
 
 		 697 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518057  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  29.61 
 
 		 574 aa  172  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  28.42 
 
 		 574 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  28.39 
 
 		 574 aa  166  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  28.85 
 
 		 633 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3989  N-6 DNA methylase  54 
 
 		 356 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  28.49 
 
 		 822 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  28.23 
 
 		 495 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.69 
 
 		 587 aa  159  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  28.48 
 
 		 522 aa  159  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  32.45 
 
 		 585 aa  156  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  27.87 
 
 		 496 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  26.94 
 
 		 505 aa  154  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  26.38 
 
 		 510 aa  152  2e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  27.09 
 
 		 815 aa  150  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  26.12 
 
 		 527 aa  150  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  28.54 
 
 		 508 aa  148  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  28.67 
 
 		 523 aa  148  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  27.47 
 
 		 504 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  28.26 
 
 		 501 aa  147  5e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  28.19 
 
 		 501 aa  146  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  25.81 
 
 		 544 aa  144  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  27.23 
 
 		 505 aa  144  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.11 
 
 		 549 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  27.13 
 
 		 814 aa  140  7.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3427  type I restriction-modification system methylation subunit-like  25.66 
 
 		 504 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  26.1 
 
 		 498 aa  140  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  25.65 
 
 		 510 aa  140  8.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  26.69 
 
 		 540 aa  140  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  26.96 
 
 		 908 aa  139  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.29 
 
 		 508 aa  139  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2925  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.16 
 
 		 708 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  28.27 
 
 		 501 aa  137  5e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  26.4 
 
 		 499 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  26.83 
 
 		 496 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  25.84 
 
 		 498 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  25.9 
 
 		 516 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  28.37 
 
 		 505 aa  135  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.38 
 
 		 497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  27.23 
 
 		 808 aa  134  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  25.73 
 
 		 544 aa  134  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.67 
 
 		 503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3609  N-6 DNA methylase  26.32 
 
 		 508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>