More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0582 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 321 aa  650    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  67.92 
 
 		 323 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  48.81 
 
 		 333 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  34.86 
 
 		 342 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  35.12 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  32.87 
 
 		 337 aa  142  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  29.41 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  32.78 
 
 		 337 aa  132  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  31.74 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  34.15 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  31.72 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  34.66 
 
 		 318 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  33.85 
 
 		 318 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  31.72 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  34.13 
 
 		 312 aa  123  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  29.6 
 
 		 314 aa  123  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  30.15 
 
 		 312 aa  122  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  31.23 
 
 		 298 aa  122  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  32.94 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  32.62 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  31.97 
 
 		 364 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  34.75 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 		 364 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  32.06 
 
 		 307 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  32.06 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  33.58 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  32.88 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  30.49 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 		 299 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  32.17 
 
 		 315 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  30.69 
 
 		 319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 342 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  30.85 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  30.18 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  30.34 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 		 347 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  34.42 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  34.82 
 
 		 319 aa  112  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  30.09 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  25.82 
 
 		 323 aa  110  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 		 343 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  32.28 
 
 		 312 aa  108  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  30.33 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  30.82 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  31.95 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  30.33 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  28.9 
 
 		 438 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  29.71 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 321 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  31.65 
 
 		 317 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  35.21 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  27.73 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  29.96 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  30.09 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  30.09 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 		 336 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  29.46 
 
 		 319 aa  102  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  28 
 
 		 319 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  31.66 
 
 		 287 aa  102  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  29.29 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  29.29 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  31.42 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  31.42 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  31.48 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  30.26 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  29 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  27.1 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  23.4 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 		 317 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  26.54 
 
 		 318 aa  99.4  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  31.16 
 
 		 597 aa  99  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 		 319 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  26.15 
 
 		 318 aa  99  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  28.76 
 
 		 319 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  28.31 
 
 		 319 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  29.67 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  28.34 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  26.34 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  32.86 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  28.18 
 
 		 317 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  30.28 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  30.28 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  30.28 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  30.28 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>