More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0580 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
679 aa  1349  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.48 
 
 
666 aa  347  6e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.81378e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5554  methyl-accepting chemotaxis protein  34.12 
 
 
676 aa  333  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5093  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.07 
 
 
676 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.68 
 
 
543 aa  326  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.26 
 
 
637 aa  325  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4403  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.26 
 
 
670 aa  314  4e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604884  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.6 
 
 
676 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.21 
 
 
676 aa  311  3e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.55 
 
 
636 aa  311  3e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0789  chemotaxis sensory transducer  34.01 
 
 
676 aa  311  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.9 
 
 
552 aa  308  2e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2834  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
671 aa  306  9e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188903  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5137  putative chemotaxis transducer  34.21 
 
 
673 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0068  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.75 
 
 
648 aa  300  5e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58650  putative chemotaxis transducer  34.16 
 
 
673 aa  298  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.03 
 
 
552 aa  297  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.26 
 
 
572 aa  295  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.72 
 
 
541 aa  294  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.85 
 
 
773 aa  294  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  46.67 
 
 
713 aa  295  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.97 
 
 
523 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.65 
 
 
637 aa  290  6e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  48.44 
 
 
712 aa  290  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  48.16 
 
 
712 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.16 
 
 
716 aa  285  1e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  50.31 
 
 
642 aa  284  4e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.67 
 
 
624 aa  282  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  48.12 
 
 
642 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  52.7 
 
 
647 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.94 
 
 
638 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.63 
 
 
640 aa  280  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.59 
 
 
674 aa  280  5e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.94 
 
 
638 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.89 
 
 
638 aa  280  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.63 
 
 
638 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.58 
 
 
438 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  51.11 
 
 
629 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.73 
 
 
552 aa  276  8e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.09 
 
 
638 aa  276  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3979  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.73 
 
 
552 aa  276  8e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.594367  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.63 
 
 
638 aa  275  1e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  50.31 
 
 
681 aa  276  1e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.26 
 
 
541 aa  274  4e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
676 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  38.12 
 
 
546 aa  271  3e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  50.48 
 
 
640 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.42 
 
 
620 aa  270  7e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000679912  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1999  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.48 
 
 
405 aa  270  9e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.09 
 
 
573 aa  268  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.96 
 
 
650 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1334  methyl-accepting chemotaxis protein  45.74 
 
 
550 aa  268  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  44.99 
 
 
541 aa  267  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  53.02 
 
 
647 aa  267  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.55 
 
 
564 aa  267  5e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  50.3 
 
 
647 aa  266  9e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.58 
 
 
634 aa  266  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.66 
 
 
674 aa  265  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.73 
 
 
647 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.12 
 
 
646 aa  265  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
739 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.61 
 
 
541 aa  263  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.7 
 
 
573 aa  263  7e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.02936  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.16 
 
 
634 aa  263  7e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  49.68 
 
 
570 aa  263  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.67 
 
 
647 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.94 
 
 
541 aa  262  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  45.4 
 
 
541 aa  262  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1713  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.52 
 
 
666 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000425798  normal  0.0665929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  50.63 
 
 
647 aa  262  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  49.2 
 
 
559 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.53 
 
 
634 aa  261  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  46.74 
 
 
640 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.98 
 
 
568 aa  261  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1124  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.4 
 
 
547 aa  261  4e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00163985  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  50.16 
 
 
640 aa  260  5e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.39 
 
 
639 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  46.57 
 
 
541 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.13 
 
 
639 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0859  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.62 
 
 
673 aa  259  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1150  chemotaxis sensory transducer  47.8 
 
 
551 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  48.25 
 
 
633 aa  259  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.31 
 
 
555 aa  259  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5159  methyl-accepting chemotaxis protein  47.65 
 
 
638 aa  259  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.62 
 
 
675 aa  258  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.6 
 
 
572 aa  258  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4022  chemotaxis sensory transducer  43.16 
 
 
493 aa  258  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.12 
 
 
674 aa  257  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.588025  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  45.59 
 
 
541 aa  258  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  44.94 
 
 
672 aa  257  5e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1912  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.24 
 
 
492 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.407863  hitchhiker  1.43908e-07 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.8 
 
 
544 aa  257  6e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.85 
 
 
546 aa  257  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3459  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.24 
 
 
492 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433284 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.24 
 
 
492 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178377  decreased coverage  7.73933e-06 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
639 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.51 
 
 
425 aa  256  1e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.37 
 
 
639 aa  256  1e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  49.84 
 
 
634 aa  256  1e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.37 
 
 
639 aa  255  2e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>